开发了新型肽凝聚体催化剂，揭示了其依赖金属和无需金属的两种催化机制，为绿色化学和先进材料领域提供了创新框架。

依赖金属和无需金属的肽凝聚体催化剂机制

开发了一种靶向软骨的水凝胶递送系统，利用PROTACs技术特异性降解BRD4蛋白，通过抑制BRD4-Nav1.7信号轴实现骨关节炎的治疗，为表观遗传调控相关疾病提供了新型靶向治疗策略。

靶向软骨的水凝胶纳米平台通过Nav1.7轴降解BRD4以缓解骨关节炎

通过将雷帕霉素包裹在PF127胶束中调节细胞生物力学特性，显著提升AAV介导的基因传递效率并降低免疫原性，为骨免疫学疾病治疗提供新策略。

调节核硬度和包膜屏障促进AAV进入细胞核并降低免疫原性

首次发现玉米感染后叶面微生物群显著分化为健康相关群落（HCom）和疾病相关群落（DCom），揭示抗菌效应子GH25通过特异性抑制HCom细菌从而促进真菌致病性，同时感染引发宿主代谢重编程形成肿瘤 sink 组织的机制。

Ustilago maydis感染玉米会重塑叶面微生物群并需要抗菌效应子的活性

首次构建了涡虫转录组高置信度m6A图谱，发现m6A分布遵循DRAYW共识序列，并揭示m6A通过调控不同细胞类型mRNA稳定性维持细胞身份的机制，特别是对干细胞和分化细胞的相反作用

m6A修饰位置对mRNA稳定性的影响与涡虫细胞身份相关

构建了覆盖128例患者的前列腺癌单细胞图谱，发现局部病变中肿瘤细胞存在基底样/俱乐部样状态转换，转移性病变中出现器官特异性基因模块激活（如骨转移的成骨信号、肝转移的红细胞样转化），提出神经内分泌前列腺癌（NEPC）的异质性由HES6等新型基因模块驱动，并开发了基于Transformer架构的PCformer模型实现细胞状态自动分类。

前列腺癌的单细胞和空间图谱揭示了谱系可塑性和转移背后基因模块的组合特性

提出开源的Openfish库和Slorado框架，突破纳米孔测序碱基识别的硬件限制，实现跨异构计算环境的高性能碱基识别，支持DNA/RNA且精度与商业软件Dorado相当。

开源、硬件无关的GPU加速可扩展纳米孔碱基识别：Slorado与Openfish

1. 首次发现LC-KF回路中谷氨酸共释放对呼吸节律的动态调节作用；2. 揭示阿片类药物通过抑制谷氨酸能突触传递导致呼吸抑制的机制；3. 通过条件性基因敲除和机器学习验证谷氨酸能信号在呼吸控制中的状态依赖性功能。

去甲肾上腺素能神经元中谷氨酸共释放调控呼吸并在阿片类药物诱导的呼吸抑制中被抑制

创新性地构建了囊性纤维化患者的单细胞免疫图谱，发现健康CFTR基因携带者存在低度系统性炎症特征，证明CFTR功能障碍存在连续性的免疫失调谱系，突破传统健康/疾病二元划分的局限性。

超越囊性纤维化的二元观点：CFTR功能障碍谱系中的系统性免疫和炎症

创新性揭示qrtA基因从Vagococcus染色体向肠球菌的水平基因转移机制，发现pELF型线性质粒作为环境耐药基因向临床肠球菌传播的载体，提出环境-临床耐药基因动态监测的One Health策略。

通过环境储库和pELF型线性质粒追踪肠球菌中新型氟喹诺酮类抗生素耐药基因qrtA的出现

通过分析15000年前的犬类遗骸基因组，揭示了家犬在早期人类社群中的关键作用，并将犬类遗传记录追溯至距今5000年前的全新时间范围。

每日简报：已知最早的犬类基因组将遗传记录回推5000年

通过解析NifEN蛋白的多结构态，揭示了FeMo辅因子前体接收、成熟和传递的隧道-开关协同机制，为理解固氮酶金属簇组装提供了关键结构依据。

固氮酶辅因子的门控机制

开发了基于单线态氧的光催化邻近标记（POCA）技术，通过结合光敏剂和亲电捕获化学，实现了在天然细胞环境中对胆固醇等分子诱饵的蛋白质相互作用组的分析。

单线态氧揭示甾醇秘密

通过重建SFTSV分子进化历史，发现病毒分为两个谱系且多样性由片段特异性重组驱动，揭示了病毒通过不同网络进行空间传播的机制。

严重发热伴血小板减少综合征病毒的分子进化与空间传播

创新性地利用DNA-药物偶联物结合杂交链式反应（HCR）实现逻辑门控的药物递送系统，通过DNA结构的精确调控实现药物释放的时空可控性，并利用HCR的链式放大效应显著提升递送效率。

DNA-药物偶联物通过杂交链式反应实现逻辑门控药物递送

提出了一种基于现代长读长技术的高分辨率宏基因组组装方法，能够更有效地恢复环状和完整的微生物基因组，优于现有工具。

使用Myloasm进行现代长读长的高分辨率宏基因组组装

通过大规模筛选高粱顺式调控突变，结合CRISPR技术实现基因表达的精确调控，为作物性状改良提供新方法

在高粱中大规模映射顺式调控突变以实现基因表达调控

首次系统性揭示未配对数据在单细胞及空间蛋白质组学研究中的核心挑战，提出数据整合与算法优化的新范式，推动多组学数据融合分析的突破。

未配对数据：单细胞和空间蛋白质组学中的首要挑战

通过大规模全外显子组测序结合电子健康记录，发现新基因-表型关联，识别2991个罕见双等位基因功能缺失相关基因，揭示高同源合子人群遗传特征。

高同源合子英国南亚裔人群的全外显子组测序与分析

提出基于深度几何感知的框架，实现异质多组学组织切片的高效对齐与空间域识别，突破跨模态数据整合与几何特征建模的技术瓶颈。

3d-OT：一种用于空间多组学异质切片对齐的深度几何感知框架

开发了通过光控激活的FLP重组酶，实现基因表达的高时空精度控制；利用遗传密码扩展技术引入光控氨基酸，使重组酶在无光照时无活性，特定波长光照下可高效激活；兼容成像和光遗传学常用波长，可在单细胞水平实现基因表达的精确操控。

光控FLP重组酶用于基因表达的精确时空控制

通过引入5-三唑基尿嘧啶增强PNA链的碱基堆积作用，解决了三螺旋结构中嘧啶识别的难题，同时保持序列特异性；分子动力学模拟和RNA-seq实验证实该方法显著提升结合亲和力和生物活性。

5-三唑基尿嘧啶改善RNA结合三螺旋形成肽核酸的碱基堆积、嘧啶识别、生物活性和特异性

创新性提出双部分裂解crRNA整合策略，消除Cas12a顺式切割活性，实现PAM非依赖性检测；提升灵敏度100-1000倍，检测时间缩短10倍；兼容多种等温扩增技术，成功应用于HPV16、SARS-CoV-2等临床检测。

消除CRISPR诊断中顺式切割以实现一次性快速核酸检出

首次揭示了uORF在果蝇中的普遍出生-死亡动态过程，发现uATG进化保守性与翻译效率的强关联，阐明谱系特异性uATGs对下游基因翻译的调控作用，并发现基因内uATG增删事件的进化补偿机制，同时揭示种群特异性选择信号与局部适应的关系。

果蝇中上游开放阅读框的产生、死亡及进化补偿

开发了整合修复结果光谱、动力学动态和功能基因调控的修复映射框架，发现DNA修复的七种模式及三种调控支柱，揭示S100A8通过抑制MMEJ与PARP1的相互作用，阐明炎症信号与DNA修复途径的串扰机制。

基于插入缺失模式的修复映射揭示CRISPR/Cas9编辑中的全基因组DNA修复网络

首次发现逆转录病毒整合过程中存在四聚体中间体，揭示了整合酶寡聚化和DNA配对的动态过程，明确了八聚体成熟intasome的形成机制，并为抗逆转录病毒药物开发提供了新靶点。

劳斯肉瘤病毒整合途径中一种新型组装中间体的鉴定

发现Cbf1通过与Okp1直接相互作用促进内动粒组装，揭示Cbf1与内动粒的互作对维持其在着丝粒稳定结合的必要性，阐明Cbf1作为连接转录阻断与CCAN组装的枢纽蛋白功能。

Cbf1与CCAN的相互依赖作用稳定酿酒酵母动粒

发现去泛素化酶抑制剂可诱导SLFN11在启动子区域的染色质招募并抑制转录，揭示RNF168通过K27连接的多泛素链修饰SLFN11中段连接域（K390/391/429）调控其染色质定位的机制，阐明SLFN11转录调控功能的泛素依赖性机制。

泛素依赖性SLFN11招募至染色质由去泛素化酶和RNF168调控

首次发现MT4-MMP通过调控NRP1依赖的VEGFA/ERK信号通路参与胚胎血管生成平衡，揭示了MT4-MMP/NRP1轴在发育性血管生成中的关键作用，并发现NRP1是MT4-MMP的底物，为中枢神经系统血管异常提供新治疗靶点。

MT4-MMP/NRP1轴在胚胎大脑平衡血管生成中的作用

首次发现钠-碳酸氢盐共转运蛋白NBCn1是纤毛膜的关键成分，通过与DYNLL1等蛋白相互作用调控纤毛长度和刺猬信号通路；揭示离子转运在纤毛信号传导中的核心作用机制，为相关疾病研究提供新靶点。

NBCn1与DYNLL1相互作用并调控纤毛长度和SUFU定位以控制声波刺猬信号

发现中心粒卫星蛋白CEP131与RNA结合蛋白UNK通过微管依赖机制调控CEP350 mRNA在S期定位至中心体，稳定其mRNA水平并维持蛋白表达；揭示CEP350在PLK4诱导的中心粒过复制中的作用及三阴性乳腺癌中心体扩增的分子机制。

中心粒卫星调节CEP350 mRNA定位及中心体扩增

首次实现端粒到端粒（T2T）组装，填补88Mb序列缺口；解析着丝粒、性染色体、rDNA结构和MHC等复杂区域；发现狨猴特异性MHC基因及500余个转录基因；构建包含四个单倍型的泛基因组框架。

普通狨猴的完整基因组

发现SUMO修饰水平与减数分裂交叉互换率在多个脊椎物种中存在正相关性，揭示SUMO通过调控染色体相关修饰水平影响交叉互换频率的机制，并在山羊品种间验证了该调控作用的进化保守性。

SUMO调控脊椎动物之间及内部减数分裂交叉互换率

创新性地结合AlphaFold 3结构建模与深度学习，首次在全蛋白质组尺度解析XPO1核输出机制，发现3000+新NES序列，揭示非典型锚定残基模式及螺旋旋转调控机制，构建疾病相关蛋白核输出图谱并发现NES-NLS串联调控模块。

基于深度学习的XPO1介导的全蛋白质组核输出图谱

创新点包括：1) 首次整合长读长测序技术（纳米孔/PacBio）的多组学分析流程；2) 实现从原始序列读段到诊断报告的全自动端到端处理；3) 将DNA甲基化分类与优先级遗传变异整合到单一可读报告中，提升中枢神经系统肿瘤诊断效率。

DIANA：用于分子神经病理学的长读长全基因组测序数据分析综合流程

创新点包括：1) 首次提出直接基于序列特征的MEI分类方法，无需依赖重复库比对；2) 在HiFi长读长数据集上显著优于现有工具，尤其在复杂结构SVA插入检测中效率提升明显；3) 能识别传统方法遗漏的着丝粒高级重复区域中的MEI。

MEIsensor：一种用于移动元件插入发现的深度学习方法

1. 发现自然反义lncRNA转录通过形成分子间dsRNA促进RNA编辑的全新机制；2. 建立两层模型揭示ADAR1主导的内源性Alu dsRNA编辑程序与独立的lncRNA反义途径协同作用；3. 首次系统解析不同乳腺癌亚型的编辑景观差异及其与脂质代谢表型的关联。

反义长链非编码RNA转录通过分子间双链RNA促进乳腺癌中A到I的RNA编辑

首次通过多模态统计分析揭示IgE谱型与肠道微生物组的关联，发现食物、花粉和尘螨三种潜在过敏成分，并发现特定菌群（如Bacteroidaceae、Oscillospiraceae）与IgE致敏的代谢关联，推翻微生物多样性差异的传统观点。

IgE模式及其与肠道微生物组在过敏致敏中的作用

首次揭示ELMO1在急性肾损伤中的保护作用，发现其在不同AKI模型中的不同影响，并阐明ELMO1在肾小管上皮细胞中的吞噬作用机制

依赖ELMO1的吞噬作用可保护免受肾毒素诱导的急性肾损伤

首次揭示无共生体珊瑚与有共生体珊瑚共享保守的生物矿化工具包，发现酸性基质蛋白的新功能（稳定无定形碳酸钙和质子缓冲），建立无共生体模型系统并提出珊瑚矿化是动态协调网络的新理论框架。

通过冷水石珊瑚骨骼蛋白质组揭示保守生物矿化机制的新见解

通过古基因组测序揭示了狗在冰河时期欧洲的遗传根源，为犬类起源研究提供了关键证据

狗在冰河时期的欧洲有深远的遗传根源

发现促癌基因融合产物ZFTA–RELA在胚胎大脑发育期通过结合特定染色质模块，导致细胞谱系癌变风险增加，揭示了癌症相关基因融合在发育过程中的潜在致病机制。

一种促癌融合蛋白在胚胎大脑发育过程中起作用

通过分析古代犬类基因组，研究将家犬驯化时间线推至冰河时代狩猎采集者时期，比此前记录提前了5000年，揭示了犬类与人类早期共存的新证据。

谁让狼进来？家犬遗传记录被推回5000年

构建了乳腺癌模型追踪B细胞成熟过程，发现抗癌抗体在进化中可能获得自身免疫性，通过转移单克隆抗体即可在小鼠中重现脑部自身免疫炎症特征，揭示了肿瘤免疫治疗可能引发神经自身免疫病的机制

抗癌抗体可能进化为引发自身免疫性脑病

通过古DNA分析发现15000年前西欧亚大陆已存在遗传同质的犬类种群，揭示了犬类驯化早期的扩散模式及与人类迁徙的关联

旧石器时代犬类在西欧亚大陆广泛分布

揭示了Cas9蛋白通过感知DNA超螺旋结构导致脱靶效应的分子机制，为优化CRISPR-Cas9特异性提供了结构基础。

超螺旋诱导的CRISPR–Cas9脱靶活性的结构基础

发现水稻SnRK1β1A基因通过促进对多种真菌病害的易感性，其基因编辑失活可赋予水稻广谱抗病性且不影响产量。

失活SnRK1β1A促进水稻广谱抗病性

发现NMDA受体在肿瘤中的异常表达可触发B细胞招募和亲和力成熟，产生调节受体功能的抗体，揭示了抗肿瘤免疫与自身免疫之间的分子连接机制。

癌症中异位NMDAR表达揭示了胚系编码的自身免疫性

通过单核染色质和RNA测序技术，首次发现表观遗传染色质结构域是儿童脑瘤（如室管膜瘤）的脆弱性靶点，揭示了在基因组‘安静’状态下肿瘤发展的表观遗传机制。

优势克隆利用发育表观基因组状态驱动室管膜瘤

通过全基因组分析发现欧洲犬类在14200年前已存在且遗传分化，其受到的新石器时代西南亚基因混合比例低于人类，并对后续欧洲犬类演化有重要贡献。

欧洲早期犬类的基因组历史

开发了基于FRET的c-di-GMP生物传感器工具箱，实现了c-di-GMP细胞动态实时监测，并通过FRET-To-Sort技术揭示了运动性与c-di-GMP调控的复杂互作网络。

基于FRET的c-di-GMP生物传感器工具箱及其FRET-To-Sort技术在c-di-GMP调控全基因组范围映射中的应用

发现溶组织内阿米巴KERP2蛋白通过结合寄生虫DNA调控毒力基因表达，并通过破坏宿主细胞肌动蛋白结构削弱上皮屏障，揭示了寄生虫感染的新机制

溶组织内阿米巴KERP2多方面调控基因表达和宿主细胞反应的模型

创新性整合单细胞测序数据与空间组学数据，结合人工智能技术构建跨尺度的哺乳动物胚胎发育预测模型，为发育生物学研究和先天疾病机制解析提供新范式。

利用基因组学和人工智能构建预测性虚拟胚胎

创新性地利用蛋白质组学发现真菌效应蛋白UmPce3与叶绿体RNA解旋酶AtRH3的互作机制，揭示其通过干扰叶绿体组装和光合作用平衡病原体增殖与宿主健康的分子机制，并验证该效应蛋白在玉米和拟南芥中的保守功能。

一种真菌效应蛋白靶向叶绿体以通过平衡疾病和植物健康来支持生物营养型生长

创新性提出线粒体膜电位动态波动（flickers）可能作为细胞内信号传导机制，而非单纯损伤标志；强调区分生理性flickers与实验伪影的方法学重要性，重新定义线粒体网络的通讯功能。

超越脉冲染料：线粒体网络中的‘闪烁’是否是其语言？

创新性开发了HiBiT/LgBiT互补系统实现EV胞质递送检测，优化信号对噪声比，通过脂质结合域替代四跨膜蛋白加载HiBiT片段，并将LgBiT定位膜系统，无需VSV-G即可检测非VSV-G EV的胞质递送，且发现其不依赖酸性晚期内吞体环境。

LUCID-EV：一种无需VSV-G表达的稳健且定量的生物发光检测方法，用于检测EV胞质递送

创新性揭示PLN R14del心肌病中SR衍生囊泡的形成机制，发现溶酶体功能障碍导致微管紊乱的病理机制，并首次提出禁食通过激活溶酶体功能可逆转该疾病进程。

禁食通过溶酶体再激活逆转PLN R14del介导的心肌病

首次揭示核糖体stalk蛋白旁系同源基因RPL12a/b的功能分歧机制，发现RPL12b缺失通过降低TORC1活性导致核糖体保护因子Stm1水平下降，进而影响细胞周期进程和寿命延长，建立了核糖体结构异质性与营养信号响应的新联系。

Rpl12旁系同源基因依赖的TOR信号通路调控核糖体保护因子Stm1的表达

创新性整合多组学数据揭示UPS突变与蛋白水平变化关系，发现具有临床价值的E3泛素连接酶及调控网络，并开发交互式分析平台UbiDash。

泛癌蛋白质基因组学对泛素蛋白酶体系统的深入研究

发现海马CA1区到次回的拓扑连接模式对空间编码的分布具有决定性作用，且该拓扑结构的破坏会特异性影响边界向量编码和长期网络稳定性，揭示了神经回路拓扑组织在空间信息处理中的关键功能

拓扑CA1输入塑造次回空间编码

创新性开发单细胞蛋白质组学技术流程，通过优化样品处理和检测方法实现高通量单细胞蛋白定量分析，首次发现NGF诱导分化过程中隐藏的细胞亚群及动态通路变化。

单细胞蛋白质组学揭示NGF诱导PC12神经元分化过程中的蛋白质组重构和细胞异质性

创新性地使用CRs特异性转基因小鼠结合病毒递送系统实现产后选择性消融，发现CRs缺失导致浅层CA1锥体细胞空间表征障碍，并揭示CRs在调控海马子回路成熟中的关键作用

海马 Cajal Retzius 细胞产后消融后 CA1 浅层锥体细胞的空间表征受损

首次发现MBNL1和MBNL2通过不同位点的二硫键形成二聚体，揭示二聚化在调控可变剪接和维持RNA簇完整性中的作用机制，并发现MBNL1二聚体具有核内功能特征。

肌肉盲样蛋白通过形成二硫键形成二聚体以调节可变剪接和致病性RNA簇形成

首次揭示FET蛋白家族成员间的功能冗余机制，发现EWSR1缺失后FUS和TAF15通过重构与新合成RNA的相互作用网络实现补偿，阐明核糖核蛋白网络在RNA稳态调控中的核心作用

FUS和TAF15维持EWSR1与新合成RNA形成的核糖核蛋白网络的关键功能

首次体外重构了微管切割酶katanin与CAMSAPs、WDR47及kinesin-13的协同作用机制，揭示CAMSAPs通过降低katanin浓度需求实现微管放大/破坏的双向调控，WDR47通过抑制katanin结合实现微管负端稳定性调控，kinesin-13则完全阻断微管放大过程，阐明了多蛋白协同调控微管动态平衡的新机制。

Katanin、CAMSAPs、WDR47和kinesin-13对微管丰度和负端动力学的调控

首次揭示MLL3/4通过调控糖酵解和线粒体呼吸关键酶（HK2/OGDH）的表达来控制干细胞分化，发现代谢重编程是表观遗传调控干细胞分化的关键机制，并证明通过过表达代谢酶可修复MLL3/4缺失导致的分化缺陷。

MLL3/4甲基转移酶通过细胞呼吸调节全能干细胞的分化

1. 首次发现IFIT3优先结合m6A修饰的HCV RNA和宿主转录本；2. 通过HyperTRIBE seq技术全转录组绘制IFIT3与m6A位点重叠图谱；3. 确定TPR1-2结构域和TPR6-7螺旋发夹结构的结构功能分离性；4. 揭示m6A修饰在抗病毒效应中的关键作用机制。

IFIT3与m⁶A修饰的RNA结合以限制丙型肝炎病毒感染

该更正文章可能修正了原研究中关于核糖体合成肽的ADP-核糖基化修饰机制的描述，或补充了该修饰在蛋白质功能调控中的新发现。

对Guo等人文章的更正：一种核糖体合成并经翻译后修饰的具有ADP-核糖基化的肽

揭示了线虫通过构建特殊结构促进跨生物界（如植物-真菌）营养物质交换的新型共生机制，为理解生态系统中复杂互作网络提供了新视角。

线虫构建的跨界生物营养相互作用通道

创新性地揭示了突变率变化的机制，突破了传统遗传漂变理论的限制，为理解进化动力学提供了新视角。

突破漂变障碍：为什么突变率会变化？

创新性地利用特异性浸润肿瘤的效应细胞作为毒素递送载体，通过局部释放致命毒素实现精准抗癌，显著降低系统性给药导致的全身毒性风险。

搭载致命毒素的效应细胞用于癌症治疗的潜力

通过早期分化文昌鱼的基因组测序，揭示了头索动物在脊索动物向脊椎动物进化过程中的关键基因演化机制，为理解脊椎动物祖先特征提供了遗传学证据。

从早期分化文昌鱼Asymmetron lucayanum的基因组和基因进化看头索动物的进化洞察

揭示了在均匀刺激条件下炎症反应的空间异质性，阐明了免疫细胞间通过信号传导实现空间协调的新型机制，并提出了区分病原体驱动空间效应的新方法论。

存在均匀刺激下的空间结构化炎症反应

首次在群体层面验证系统漂移理论，揭示系统组件可在选择约束下独立进化并导致物种间功能差异的机制

定量系统漂移

发现SUN5蛋白通过构建规则蛋白晶格结构，强化精子头尾连接处的机械稳定性，揭示了LINC复合物在精子结构中的新功能机制，并利用超分辨率显微镜技术解析了亚细胞尺度的蛋白排列规律。

SUN5形成规则蛋白晶格增强精子头尾连接处

首次揭示转谷氨酰胺酶2（TG2）的交联活性是驱动α-突触核蛋白病理形成的核心机制，为突触核蛋白病（如帕金森病）提供了新的治疗靶点。

转谷氨酰胺酶2的交联活性驱动突触核蛋白病模型中的α-突触核蛋白病理学

发现光感受器通过进化保守的分子通路调控生物生长和寿命，揭示了光环境对发育和衰老的分子机制，为理解环境因素与生物节律的交互作用提供新模型。

光感受器通过进化保守的分子通路调控多毛纲环节动物的生长和寿命

首次通过整合结构生物学方法解析RIPK1纤维的原子级三维构架，阐明其高阶组装的分子机制，为理解蛋白质高阶结构功能关系及结构设计提供新范式。

整合结构生物学揭示RIPK1纤维高阶结构的原子级构架与组装机制

首次揭示SMARCA4与TMEM47蛋白轴在基孔肯雅病毒RNA复制中的核心调控作用，为开发针对该病毒的新型抗病毒药物提供了潜在靶点。

SMARCA4–TMEM47轴在基孔肯雅病毒RNA复制中发挥关键作用

首次发现CLSTN3通过抑制TLR的N-糖基化修饰和膜定位，从而负向调控TLR介导的炎症反应，揭示了新的炎症调控机制

Calsyntenin-3通过抑制TLR的N-糖基化和膜定位来抑制炎症

揭示了EpeE酶在RiPP天然产物生物合成过程中对不同修饰位点的特异性反应机制，为理解复杂天然产物的合成途径提供了新视角。

自由基SAM酶EpeE在RiPP天然产物epipeptide生物合成中表现出独特的位点反应性

开发了位点定向的自旋标记技术，可在复杂细胞环境中特异性增强RNA的核磁共振信号，突破传统NMR对RNA结构动态研究的局限性。

通过位点定向双硝基氧自由基标记实现RNA的靶向核磁共振信号增强

构建了覆盖近2000个转录因子的全基因组图谱，首次发现TOX3作为Atoh1共激活因子在小脑发育与肿瘤发生中的双重调控机制，为神经发育疾病和肿瘤治疗提供新靶点。

转录调节因子图谱揭示TOX3在小脑发育和肿瘤发生中的Atoh1共激活因子作用

首次发现猴痘病毒OPG188蛋白通过核酸酶活性降解2′3′-免疫信号分子，从而抑制宿主cGAS–STING通路；揭示病毒免疫逃逸新机制，为抗病毒治疗提供潜在靶点。

猴痘病毒蛋白OPG188拮抗cGAS–STING抗病毒信号通路以介导免疫逃逸

发现水稻UDP-葡萄糖基转移酶IAAspGT催化N-糖基化反应，揭示糖基化修饰通过调控生长素代谢影响水稻生长性状的新机制，为植物生长调控提供分子靶点

吲哚-3-乙酰氨基酸的N-糖基化调控水稻生长素代谢和生长性状

首次明确C4BP是抗磷脂酰乙醇胺自身抗体的抗原靶点，揭示了此类抗体通过靶向补体系统调节免疫应答的致病机制，为自身免疫性疾病的治疗提供了新靶点。

C4b结合蛋白作为抗磷脂酰乙醇胺自身抗体发病机制中的抗原靶点

发现大肠杆菌中大量ORFans基因主要来源于水平基因转移而非自身基因复制演化，颠覆了传统认为ORFans由基因复制产生的观点，揭示了细菌基因组演化中基因获取机制的重要性。

外源导入而非自身演化基因在大肠杆菌ORFans中占主导地位

发现FMT蛋白通过与NAC转录因子相互作用，调控核基因编码的线粒体蛋白在细胞内的翻译定位，揭示了细胞器蛋白合成的空间调控新机制。

拟南芥友好（FMT）蛋白与NAC相互作用并决定核编码线粒体蛋白的翻译位置

创新性地结合Hi-C接触图谱与能量景观方法，揭示SMC复合物通过重塑染色体结构实现DNA分离的分子机制

探索细菌染色体分离的能量景观

通过基因组分析发现真核生物的植烷醇合成核心基因集源自粘细菌的水平基因转移，揭示了这一关键膜脂代谢途径的进化起源机制，解决了其在真核生物中分布不均的进化谜题。

真核生物植烷醇生物合成起源于粘细菌的水平基因转移

揭示ATP13A2通过调节线粒体稳态抑制巨噬细胞NLRP3炎症小体激活的新机制，为理解帕金森病免疫病理机制提供理论依据。

ATP13A2通过调节线粒体稳态抑制巨噬细胞NLRP3炎症小体激活以抑制神经退行性变

开发了一种基于合成SIGLEC9的嵌合开关受体，通过改造CAR巨噬细胞的信号传导机制，显著提升其对抗胶质母细胞瘤的治疗效果。

基于合成SIGLEC9的嵌合开关受体增强CAR巨噬细胞对抗胶质母细胞瘤的疗效

首次解析了结核分枝杆菌长链酰基辅酶A羧化酶复合物的三维结构，揭示了其底物特异性识别机制及与MSMEG_0435-0436蛋白相互作用的分子基础，为抗结核药物开发提供新靶点。

结核分枝杆菌长链酰基辅酶A羧化酶复合物底物特异性及MSMEG_0435-0436结合的结构基础

开发了一种基于无染色体、非复制细胞的抗菌治疗平台，通过工程化改造细胞实现精准抗菌功能

重编程的SimCells用于抗菌治疗

首次揭示磷酸化修饰与DNA损伤修复通路在SOX2介导的胶质细胞重编程中的协同调控机制，发现两个关键分子开关解决重编程效率瓶颈，为中枢神经再生提供新靶点

磷酸化与DNA损伤修复协调SOX2介导的体内重编程

发现SEL1L–HRD1介导的ERAD（内质网相关降解）与自噬通路的协同作用，揭示了棕色脂肪细胞在高代谢压力下通过蛋白质质量控制维持线粒体稳态的新机制。

SEL1L–HRD1 ERAD-自噬相互作用维持棕色脂肪细胞中的线粒体稳态

创新性地构建了α-突触核蛋白蛋白稳态网络的定量评估框架，为神经退行性疾病的蛋白稳态崩溃机制研究提供了新范式。

α-突触核蛋白蛋白稳态网络及其在帕金森病中的转化应用

首次发现POLR3A/POLR3C基因有害变异导致RNA聚合酶III功能缺陷，揭示线粒体DNA感知障碍与重症COVID-19患者I型干扰素免疫缺陷的分子机制

肺上皮细胞中RNA聚合酶III对线粒体DNA的感知缺陷损害了对SARS-CoV-2的I型干扰素免疫

发现去泛素化酶DUO-1通过调控泛素化修饰动态，维持减数分裂中染色体结构的稳定性，揭示了染色体结构重塑与泛素化系统之间的新机制

去泛素化酶DUO-1通过主动维持秀丽隐杆线虫减数分裂特异性染色体结构

开发了高亲和力、结构验证且选择性的大环肽工具，为研究亨廷顿蛋白的分子功能提供了新的化学生物学研究手段。