曲霉菌5'和3'非翻译区的全面映射揭示了包括提前转录终止在内的mRNA加工多样化机制RNA Journal创新性使用5'和3'端测序技术实验确定转录起始位点和多聚腺苷酸化位点,发现上游开放阅读框和RNA结合蛋白结合位点,揭示替代启动子/终止子使用及首次在Eurotiomycetes中发现近启动子提前转录终止现象。2026-1-16 测序技术
裂变酵母Tpt1由串联的RNA 2'-磷酸转移酶和Yae1结构域组成,两者对生存均至关重要RNA Journal发现裂变酵母Tpt1包含两个功能独立的结构域(RNA 2'-磷酸转移酶和Yae1),且二者均对生存必需;揭示了Arg50和Arg96在Tpt1催化反应中不同步骤的关键作用;推翻了Tpt1均为单功能单元的传统认知。2026-1-16 核酸蛋白工具酶
新型三核苷酸mRNA帽试剂:改进的合成路线及高效的共转录掺入RNA Journal开发了'一锅两步法'合成三核苷酸帽引物(TCPs)的新方法,产率提升且纯化步骤简化;发现TCP与DNA模板在转录起始位点+1和+2位点的完全互补是实现高效率(>98%)和高产率(>5 mg/mL)帽结构mRNA合成的关键2026-1-16 合成生物学
利用m5C-Rol-LAMP检测大肠杆菌中应激依赖性m5C rRNA动态变化RNA Journal开发了基于qPCR的m5C-Rol-LAMP方法,首次发现细菌rRNA修饰水平具有应激依赖性和位点特异性可逆变化,实现了RNA修饰的定量检测。2026-1-16 测序技术 核酸蛋白工具酶
微型NAD+-II核糖开关控制细菌烟酰胺补救及从头合成NAD+基因 [报告]RNA Journal发现更丰富的mini-NAD+-II核糖开关新亚类,揭示其在乳酸菌中广泛分布的代谢调控功能;发现其H型假结结构与preQ1-I核糖开关的结构相似性,为合成生物学中人工设计配体结合aptamer提供新思路。2026-1-16 合成生物学
5' UTR顺式调控逻辑调控经典和非编码RNA上的核糖体结合RNA Journal1. 系统解析5' UTR结构对mRNA与ncRNA翻译效率的差异化调控机制;2. 开发基于机器学习的plusCE模型,显著提升翻译效率预测精度;3. 揭示核糖体结合ncRNA的非编码进化特征,修正对ncRNA翻译潜力的误判。2026-1-16 测序技术 蛋白质组学
PANTHER评分:蛋白质-核酸靶标结合、杂交和能量回归RNA Journal创新性提出基于分子动力学模拟和机器学习的局部到全局预测框架,通过五步流程实现蛋白质-RNA结合自由能预测,其中随机森林回归模型在测试集和压力集均表现出色(Pearson相关系数0.80/0.64,MAE 1.79/1.63 kcal/mol),且优于现有工具。2026-1-16 蛋白质组学 核酸蛋白工具酶
MUTACLASH:利用交联诱导的突变识别功能性小RNA靶点[报告]RNA Journal开发MUTACLASH工具系统分析CLASH数据集中的交联诱导突变(CIMs),发现CIMs可作为Argonaute蛋白结合的分子足迹,尤其在非典型miRNA/piRNA结合位点和低杂交丰度靶点中表现出更强的调控效应,为识别被现有工具忽略的功能性小RNA靶点提供新方法。2026-1-16 测序技术 核酸蛋白工具酶
更正:ProQ和FinO对RNA的不同识别取决于内在终止发夹结构周围的序列[CORRIGENDUM]RNA Journal揭示ProQ和FinO两种蛋白质通过识别不同RNA序列来调控基因表达终止的机制差异,特别是与内在终止发夹结构周围序列的依赖性。2025-12-16 核酸蛋白工具酶 蛋白质进化
端粒和间质位点的TERRA转录本和启动子[报告]RNA Journal创新性地利用最新T2T-CHM13v2.0参考基因组发现46个亚端粒中39个TERRA启动子,并首次识别出106个染色体内部TERRA样启动子;揭示了端粒和间质启动子属于新的重复序列家族;通过RT-PCR和RNA-seq证实ITSs可转录TERRA,且转录水平与端粒重复序列长度相关。2025-12-16 测序技术
酵母中Prp8 α-指结构域内高度保守的氨基酸对3'剪接位点选择的调控RNA Journal发现Prp8 α-指结构域中谷氨酰胺1594通过与3'剪接位点-3位嘧啶直接相互作用,调控剪接体对3'剪接位点的选择性;Prp8 Q1594A突变体通过放松序列要求改变相邻剪接位点竞争,揭示Prp8 α-指结构域作为剪接体活性位点传感器的新机制,并阐明其与Prp22的协同作用机制。2025-12-16 测序技术 蛋白质组学 基因编辑
保守蛋白Seb1通过与RNA聚合酶II和RNA相互作用作为反暂停转录延伸因子RNA Journal首次发现CID-RRM家族蛋白Seb1具有双向调控Pol II暂停的上下文依赖性功能,并揭示其通过调节转录速率协调pre-mRNA加工与转录终止的新机制2025-12-16 蛋白质组学