单细胞测序 | 标签

解卷积肿瘤脂肪细胞比例与高级别浆液性卵巢癌生存率

创新性构建单核脂肪细胞谱型与HGSOC单细胞数据的复合参考，首次揭示肿瘤内脂肪细胞比例与卵巢癌患者生存率的显著负相关，并验证了免疫细胞比例与预后的正相关性。

过度激活的YAP1驱动宫颈鳞状细胞癌侵袭性EMT亚型

发现YAP1通过破坏Hippo-YAP信号通路驱动HPV独立的侵袭性宫颈癌亚型，该亚型缺乏表面病变可逃避免疫筛查；首次结合单细胞测序与空间转录组学揭示其分子机制，发现EMT高表达状态与免疫抑制性髓系抑制细胞互作促进肿瘤进展，并提出靶向Hippo信号通路的新治疗策略。

单细胞测序

空间组学

高血压下肾小管相关支持细胞转录可塑性增强

首次发现高血压小鼠肾小管相关支持细胞存在显著转录可塑性变化，通过单细胞测序揭示其差异表达基因达299个，富集51-86条关键通路，并发现180个特异性调控网络。同时对比发现该细胞类型较淋巴内皮细胞具有更强的抗炎能力和再生潜力，为高血压肾损伤治疗提供新靶点。

单细胞测序

Af-CUT&Tag：一种基于基因编码标签和高亲和力结合蛋白融合Tn5的无抗体染色质分析方法

创新性地提出无抗体染色质分析方法，通过CRISPR整合的肽标签实现高灵敏度的转录调节因子定位，同时兼容批量和单细胞测序技术

基因编辑

单细胞测序

核酸蛋白工具酶

表观遗传和表型上独特的肿瘤周围胶质母细胞瘤细胞群与患者预后较差相关

首次发现肿瘤边缘区域存在表观遗传和表型独特的胶质母细胞瘤细胞亚群，揭示微胶质细胞来源的Oncostatin-M是驱动该亚群形成的分子机制，并证实该亚群与患者预后显著相关

单细胞测序

测序技术

缺血心脏中性粒细胞的终末编程驱动心肌梗死后纤维化

首次揭示外周中性粒细胞在心肌梗死后通过TGFβ/GM-CSF受体上调被预先编程为SiglecF+状态的机制，发现Ly6G靶向干预可诱导心脏中性粒细胞向SiglecF+Ly6Glo/Retnlghi表型转化，并通过γδT细胞和单核细胞募集及直接作用成纤维细胞促进纤维化。

单细胞测序

从整体肿瘤测序中重建克隆解析的转录程序

提出PICTographPlus框架，首次整合DNA推断的克隆系统发育树与整体RNA-seq数据，通过系统发育树正则化混合模型实现克隆特异性基因表达推断，揭示肿瘤进化过程中关键通路的获得与丢失事件。

测序技术

单细胞测序

AtlasMap：实现低成本、地图式探索百万细胞单细胞图谱

创新点包括：1) 采用离线预处理生成四叉树空间聚合数据；2) 使用压缩Zarr v3格式存储聚合结果；3) 基于Go语言的高性能后端动态渲染PNG瓦片；4) 通过服务端计算卸载实现浏览器端低内存占用（<5MB）；5) 实现与数据集规模解耦的可视化性能。

单细胞测序

空间组学

真实配对单细胞/批量RNA测序基准及人支气管肺泡灌洗液样本中准确细胞类型解卷积的实用协议

1. 首次建立真实配对的单细胞/批量RNA测序基准框架，揭示了真实批量与伪批量数据间的系统性基因差异；2. 证明协议匹配的内部参考优于大规模外部参考，尤其在高分辨率细胞类型解卷积中表现更优；3. 提出通过识别并剔除不一致基因提升解卷积精度的实用方法；4. 提供基于小样本构建内部参考的低成本实验方案，显著提升跨组织平台研究的准确性。

单细胞测序

测序技术