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GPSeq沿核周-中心轴映射真核生物基因组的径向组织

创新性地提出GPSeq技术，通过从核周向内逐步酶解染色质并结合高通量测序，首次实现对真核生物基因组沿核周-中心轴的径向组织结构的全基因组尺度解析。

发现YAP1通过破坏Hippo-YAP信号通路驱动HPV独立的侵袭性宫颈癌亚型，该亚型缺乏表面病变可逃避免疫筛查；首次结合单细胞测序与空间转录组学揭示其分子机制，发现EMT高表达状态与免疫抑制性髓系抑制细胞互作促进肿瘤进展，并提出靶向Hippo信号通路的新治疗策略。

创新性地应用质谱成像技术定位肾脏中皮质类固醇的空间分布，发现不同激素在肾乳头、髓质和皮质的分布规律，并揭示低盐饮食会显著增加外皮质区皮质酮含量，为理解激素在肾脏功能区的信号调控提供新视角。

创新性提出结合肿瘤标志物的智能体模型（BEP-HI），揭示肿瘤生长动力学与异质性的机制解耦，发现免疫招募通过非线性免疫编辑反馈主导ITH演化，阐明黑色素瘤细胞迁移能力与肿瘤形态的关联性。

开发了能够模拟人类肝脏门静脉区域结构和功能的类器官模型，为肝脏疾病研究和药物筛选提供新工具。

创新性提出Corrected Spatial Differential Expression (CSDE)方法，通过引入专家验证的少量数据点校正预处理误差带来的不确定性；设计高效的工作流生成专家标注数据，提升空间转录组差异表达分析的可靠性。

发现EGR-1结合位点是CSF1R激活的关键开关，揭示CSF1R基因位点通过三维折叠形成调控枢纽，阐明EGR1作为巨噬细胞特异性边界元件在增强子-启动子环形成中的全局作用。

创新点包括：1) 采用离线预处理生成四叉树空间聚合数据；2) 使用压缩Zarr v3格式存储聚合结果；3) 基于Go语言的高性能后端动态渲染PNG瓦片；4) 通过服务端计算卸载实现浏览器端低内存占用（<5MB）；5) 实现与数据集规模解耦的可视化性能。

创新性地整合成像技术和测序技术于同一组织切片，通过统一的实验和计算流程实现转录组分析与多重蛋白成像的联合分析

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