bioRxiv | 分类

bioRxiv

MAPT基因位点的启动子诱变和大规模并行报告基因筛选揭示顺式调控元件及遗传变异效应

创新性结合CRISPRi筛选与MPRA技术，发现MAPT基因新顺式调控元件，通过饱和诱变分析揭示神经元特异性调控变异，定位关键转录因子结合位点，为tauopathies治疗提供新靶点。

创新性地构建了首个Tuba4a突变导致常染色体显性痉挛性共济失调和肌病的小鼠模型，通过CRISPR技术验证了Tuba4aQ176P突变的致病性，并揭示该模型特异性呈现SPAX11和CMYO26表型而无运动神经元退化，为研究TUBA4A突变的细胞类型特异性效应提供了工具。

提出无需复杂预处理的单细胞数据映射框架，支持跨物种和多模态数据（转录组/表观组/空间组学）的高效映射，提供可解释的置信度评估体系，并兼容扩展脑图谱参考体系。

创新性整合单细胞测序与可解释机器学习方法，发现血源性生物标志物预测治疗反应（AUC>0.93），并通过LIME模型解析关键调控因子（如EGR1、GZMB），为TNBC个性化治疗提供新思路。

提出SPAE模型（基于自编码器的分段线性模型），显著提升单细胞RNA测序数据中细胞周期动态分析的准确性与鲁棒性；可预测癌症细胞周期转换并有效去除细胞周期效应。

提出scEvolver框架，通过记忆引导的持续学习机制优化细胞类型表示，解决灾难性遗忘和批次偏差问题，实现跨平台、跨组织、跨模态的知识整合与泛化。

创新性整合多视角特征（序列、结构约束、物理化学属性、语言模型嵌入），首次实现跨物种且不受功能类别影响的稳定预测，揭示棕榈酰化调控的通用机制

通过冷冻电镜技术解析Gβ1γ2与预融合SNARE复合物的相互作用结构，首次揭示其通过阻断SNARE复合物完全组装来抑制囊泡融合的分子机制，并发现Gβ1γ2与complexin可协同作用于同一SNARE复合物。

发现Ufd1的UT3结构域通过同时结合两个Lys48连接的泛素并展开其中一个泛素，从而启动Cdc48/p97的底物处理过程，揭示了泛素展开的分子机制及连接特异性识别机制。

创新性地通过定量分析揭示了Kai蛋白复合物形成动力学的层级机制：1) A2C6复合物形成具有磷酸化状态依赖的分级特性；2) B6C6复合物形成具有超磷酸化选择性的开关特性；3) KaiA在复合物间的快速再分配机制，为生物钟振荡的动态调控提供了分子基础。

首次建立植物合成mirtron平台，通过剪接依赖的非典型PTGS机制实现基因沉默；精确的内含子剪接和套索去分支是沉默关键；在病毒抑制剂P19存在时仍有效；可与宿主基因共表达并继承其时空表达模式；适用于作物基因功能研究和生物技术改良。

首次构建三个ataxin-1家族基因的斑马鱼敲除模型，发现其在发育、行为和转录组层面的特异性与共性改变，揭示了ATXN1家族基因在神经免疫调控、感觉运动行为及视网膜信号中的作用机制。

...

...

NotionNext

一个普通的干饭人🍚