处于启动子位置的Rpd3 HDAC复合物在营养转换过程中协调全基因组染色质重编程bioRxiv揭示Rpd3 HDAC复合物通过动态调控组蛋白乙酰化状态,在营养转换时协调全基因组染色质重编程,解决HDAC在活跃启动子富集的生物学悖论,并阐明其作为代谢调控开关的作用机制。2026-2-20 测序技术 蛋白质组学
ProteoMapper:对齐感知的蛋白质家族上下文基序-结构域模式识别与定量分析bioRxiv创新点包括:1) 首次整合HMMER结构域注释与用户自定义基序检测;2) 提出位置保守性评分(≥60%序列坐标一致)和基序-结构域覆盖率得分(MDCS)两个量化指标;3) 支持Excel格式对齐文件处理且无需编程;4) 并行计算实现快速分析(150序列完整Pfam扫描<6秒);5) 在三个蛋白家族验证中展现高精度(PLATZ转录因子0.94交并比,ERD6运输蛋白揭示进化分歧)。2026-2-20 蛋白质组学 蛋白质进化
面向单细胞批次校正的几何感知与可解释深度学习:基于显式解耦与最优传输bioRxiv创新性提出iDLC框架,通过显式特征解耦分离生物与技术因子,结合最优传输正则化对抗对齐实现几何约束分布对齐,有效消除复杂批次效应同时保留细胞亚型、发育轨迹等关键生物信息,可处理百万级单细胞数据2026-2-20 单细胞测序
QuantiTrack:一种用于研究活细胞中蛋白质动态的统一软件bioRxiv开发了基于MATLAB的单分子追踪分析软件QuantiTrack,提供图形化用户界面实现端到端分析流程,集成质量控制指标和多维度分析功能,通过激素治疗案例验证其在蛋白质动态研究中的应用价值。2026-2-20 蛋白质组学
RBPscan:一种定量的体内工具,用于分析RNA结合蛋白的相互作用Molecular Cell创新点包括:基于RNA编辑技术开发定量分析方法,可量化蛋白-RNA结合强度、识别结合基序并定位结合位点,为解析转录后调控提供通用工具。2026-2-6 基因编辑 蛋白质组学
TBK1通过感知天冬酰胺调控其相分离以驱动抗病毒先天免疫反应Molecular Cell发现TBK1作为天然的天冬酰胺传感器,揭示其相分离机制在连接宿主营养稳态与先天免疫中的关键作用,并提出通过调控天冬酰胺可用性治疗感染性疾病的策略。2026-2-6 蛋白质组学
LGP2介导MDA5成核及丝状结构形成的分子机制Molecular Cell发现LGP2通过结合dsRNA末端并内部易位启动MDA5丝状结构形成,使MDA5能够识别短病毒RNA;异质丝状微簇群可高效激活MAVS信号通路,扩展先天免疫检测范围。2026-1-19 核酸蛋白工具酶
HSPA1A和DNAJB1调控NELF凝聚体动力学以在热应激条件下保障转录恢复Molecular Cell发现分子伴侣HSPA1A和DNAJB1通过维持NELF凝聚体的可逆性,保障热应激后转录恢复的机制,揭示了蛋白质相分离动态与转录调控的关联。2026-2-6 蛋白质组学
人类BAF染色质重塑器处理由先驱转录因子OCT4–SOX2结合的核小体Molecular Cell首次揭示BAF染色质重塑器与先驱转录因子结合核小体的动态互作机制,发现转录因子可通过定向调控BAF重塑过程影响基因组可及性,为理解表观遗传调控提供了新视角。2026-2-11 蛋白质组学 核酸蛋白工具酶
RAD51琥珀酰化调控同源重组并影响癌症的化疗敏感性Molecular Cell首次发现OXCT1和HDAC11通过调控RAD51的琥珀酰化修饰,抑制同源重组修复从而增强肿瘤细胞对化疗的敏感性,揭示了表观遗传修饰与DNA修复通路的新调控机制2026-2-11 蛋白质组学
转录调控中的密度转变Molecular Cell该综述澄清了分子机器、可溶性高阶复合物与冷凝物之间的差异,突出了冷凝物的新兴特性,并提出了解析密度转变在不同生物背景下功能相关性的研究方法。2026-2-6 蛋白质组学