高通量配体多样化以发现化学诱导邻近效应的分子Nature Chemical Biology开发了一种高通量方法,通过修饰现有配体生成分子胶降解剂,突破传统分子胶降解剂依赖偶然发现的局限性2026-2-16 合成生物学
工程化细胞免疫疗法治疗自身免疫疾病临床进展Nature Biotechnology综述了最新开发的工程化细胞免疫疗法在自身免疫疾病治疗中的临床数据,强调其通过精确调控免疫细胞功能实现疾病治疗的潜力。2026-2-16 基因编辑 合成生物学
一种新型双组分系统通过调控莽草酸途径实现热泉古菌Thermus thermophilus的热适应NAR发现新型热敏感双组分系统DhqSR,其组分DhqS通过His327自磷酸化感知温度变化,响应调节因子DhqR通过非典型的酪氨酸磷酸化(Tyr84)激活,该系统直接调控莽草酸途径关键酶DHQase以实现热适应,揭示了微生物温度感知的新机制。2026-2-16 蛋白质组学 合成生物学
构建基于人类的翻译激活因子以实现靶向蛋白质表达恢复NAR开发了基于CRISPR-Cas启发的CIRTS平台,通过工程化人类蛋白实现靶向mRNA翻译激活,成功在Dravet综合征小鼠模型中验证了该技术可恢复SCN1a蛋白表达并改善疾病表型。2026-2-16 基因编辑 合成生物学
设计依赖性缺陷揭示DNA折纸中的复杂协同作用NAR通过设计变化分析DNA折纸组装中的协同作用机制,开发了关联热稳定性、短折叠有益协同作用和长折叠有害协同作用的指标体系,并发现单一参数可显著预测组装产量,为协同作用与设计的交互提供预测性理解框架。2026-2-16 合成生物学
使用语言模型设计原核生物顺式调控元件NAR创新性提出无需实验数据的原核生物顺式调控元件设计模型PromoGen2,实现跨物种启动子强度预测相关性提升(Spearman相关性从0.27到0.50),开发Promoter-Factory框架实现未注释基因组启动子设计,并构建基于分类的PromoGen2-proka模型,实验验证显示在多个原核生物中成功率达100%。2026-2-16 合成生物学
基于机器学习的Toehold-VISTA:解析可编程RNA传感器-靶标相互作用的方法NAR创新性提出VISTA框架,整合生物物理建模与机器学习(偏最小二乘判别分析),通过高通量实验数据训练预测模型,实现RNA传感器的快速设计与性能优化,成功应用于SARS-CoV-2 RNA检测。2026-2-16 合成生物学
CodonRL:基于示范引导强化学习的多目标密码子序列优化bioRxiv提出CodonRL框架,通过结构先验学习与示范引导回放解决密码子优化问题,结合LinearFold和ViennaRNA实现高效奖励计算与评估,引入里程碑奖励机制应对长距离优化中的延迟反馈问题,在多指标上优于现有方法。2026-2-14 合成生物学 蛋白质组学
一种能够合成自身及其互补链的小型聚合酶核酶 | ScienceScience开发了一种新型小型聚合酶核酶,突破了传统RNA聚合酶核酶因结构复杂而无法实现自我复制的限制,首次实现了核酶的自主合成及其互补链的生成,为研究生命起源的自我复制系统提供了关键模型。2026-2-12 合成生物学 核酸蛋白工具酶
具有进化见解的酶检索几何基础模型Nature Catalysis开发了基于几何深度学习的EnzymeCAGE模型,通过结合进化信息显著提升了未表征酶功能预测的准确性,并实现了生物合成途径的重建。2026-2-12 蛋白质组学 合成生物学 蛋白质进化
生成式AI引导的高亲和力T细胞受体设计bioRxiv提出TCRPPO2模型,整合强化学习与生成式AI批评机制,通过迭代突变策略优化TCR亲和力,结合物理建模与功能注释筛选,实现无需结构监督的TCR工程化设计,并在临床相关抗原验证中展示显著功能提升。2026-2-12 蛋白质进化 合成生物学
热响应变构蛋白的模块化工程Nature Chemical Biology开发了可插入的紧凑型热响应模块,首次实现对多种蛋白质的变构热调控,扩展了热遗传学技术的适用范围2026-2-12 合成生物学 蛋白质进化