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使用GRAPE分析组合性敲除CRISPR筛选：基因互作回归分析及成对效应

提出GRAPE计算框架，通过线性回归分析单基因表型并检测双重敲除效应偏差；开发Synulator模拟工具实现基准测试，显著提升弱效应互作的检测精度；跨平台验证显示可发现新高置信度合成致死互作。

开发了特异性靶向果蝇大脑章鱼胺/酪胺神经元的转基因工具，实现了细胞类型特异性的神经环路解析；首次发现抑制攻击行为的新型章鱼胺能神经元；整合电子显微镜连接组数据实现多模态神经分析。

提出整合1D表观遗传轨迹和3D染色质互作的深度学习框架，通过残差卷积网络与图神经网络（含图注意力和图变换器）建模局部与远距离调控影响；无需DNA序列嵌入即可实现与序列基模型相当的预测性能，且计算效率更高。

创新性地采用启动子编辑策略调控水稻抗性淀粉（RSC）与直链淀粉（AC）的平衡，发现AC与RSC在BEIIb缺陷型水稻中存在正相关关系，并开发出同时提升RSC且控制AC的水稻新种质。

发现脆性X综合征（FXS）的运动障碍可能源于超脊髓或整合回路功能障碍，而非脊髓中央模式发生器（CPG）固有缺陷；揭示脊髓回路可通过代偿机制维持基础运动功能。

创新性地结合CRISPR-Cas9系统与机器学习算法，实现了DNA数据存储的高效随机访问和语义搜索功能，突破了传统DNA存储技术的检索效率瓶颈。

创新性提出IOD方法，无需引入非天然attB位点即可实现原核生物基因组的单步定点整合，通过系统挖掘细菌/古菌天然整合酶与attB位点的适配性，突破传统整合酶技术对模型生物的依赖，拓展至非模式/非培养菌的基因组编辑。

首次系统评估了三种RNA靶向CRISPR-Cas系统（Cas7-11S、hfCas13X、hfCas13d）在感觉神经元中的敲低效率及细胞毒性，发现hfCas13d在实现高效基因沉默的同时对神经元健康影响最小，为神经科学研究和治疗应用提供了新工具。

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一个普通的干饭人🍚