使用Omnipeak进行精确的染色质标记峰值检测NAR提出基于约束三态隐马尔可夫模型的通用无监督算法,可处理不同长度(窄峰/宽峰)、质量差异及缺失对照数据的染色质测序数据,通过550+真实和300+合成数据集验证其在重复一致性、噪声鲁棒性和跨数据类型适应性方面的优势。2026-1-9 测序技术
HLTF与GATA1协作在红细胞发育过程中激活转录程序和染色质重塑NAR1. 首次发现HLTF是GATA1的新调控因子,通过结合GATA1启动子增强其转录;2. 揭示HLTF通过维持染色质可及性激活红细胞基因网络;3. 发现HLTF与GATA1形成正反馈调控环路;4. 阐明HLTF在红细胞疾病(如真性红细胞增多症和骨髓增生异常综合征)中的异常表达及功能作用。2026-1-9 测序技术
连接组蛋白H1.5有助于维持着丝粒完整性NAR首次发现H1.5通过与CENP-A单核小体相互作用参与着丝粒调控,其缺失导致α卫星转录丢失、CENP-A加载异常、动粒蛋白基因表达紊乱及有丝分裂缺陷,揭示了特定H1变体在维持有丝分裂完整性中的新功能。2026-1-9 蛋白质组学 测序技术
STAN:一种用于推断空间信息转录因子活性的计算框架NAR创新性提出STAN线性混合效应模型,首次整合TF-靶基因先验知识、mRNA表达数据、空间坐标和组织学特征,实现空间特异性转录因子活性预测,揭示TF与空间组织的交互作用机制。2026-1-9 空间组学 测序技术
母源性TDP43在小鼠卵母细胞到胚胎转变过程中调控核斑点组装和合子剪接激活NAR首次发现TDP43通过液-液相分离调控核斑点组装,揭示其作为合子剪接激活上游调控因子的双重作用机制(促进正常剪接和抑制过度剪接),并阐明其在胚胎发育与细胞全能性-多能性转换中的关键作用。2026-1-9 蛋白质组学
昆虫视叶中时间性转录因子系列的进化动力学bioRxiv揭示了昆虫视觉脑时序系列的保守基序与物种特异性变异,发现时序程序通过共享支架的反复修改进化,并阐明了时序模式变化如何导致神经元类型身份的改变。2026-1-9 蛋白质进化
从高质量全基因组群体水平数据推断铜背titi猴(Plecturocebus cupreus)的种群历史bioRxiv创新性地利用六只个体的全基因组深度测序数据,通过非编码区变异分析推断种群动态,并将种群规模变化与冰期气候变迁进行关联,为灵长类物种的演化研究提供新视角。2026-1-9 测序技术
SegJointGene:基于信息熵引导的卷积神经网络的联合细胞分割与空间基因优先级排序bioRxiv创新性提出联合细胞分割与空间基因优先级排序的深度学习框架,通过信息熵引导的卷积神经网络整合核图像与空间基因表达数据,利用计算信息丢弃(CID)评分实现基因重要性优先级排序,并通过迭代优化实现分割与基因优先级的协同收敛。2026-1-9 空间组学 蛋白质组学
多克隆和单克隆患者来源的食管Barrett上皮和食管腺癌类器官模型建立疾病进展和治疗反应异质性分析平台bioRxiv创新性构建涵盖正常食管组织、Barrett食管和食管腺癌的116个患者来源类器官库,开发单细胞克隆培养技术揭示肿瘤异质性,发现Barrett食管调控成纤维细胞表型的作用,并系统解析食管腺癌对多种治疗方式的响应差异。2026-1-9 测序技术 单细胞测序
加利福尼亚中部南方海獭的钩端螺旋体病:致命感染的检测及病理发现bioRxiv首次在南方海獭中检测到L. interrogans serovar Pomona感染,确定钩端螺旋体病与海獭死亡的病理关联,揭示降雨量与感染季节的相关性,为海洋哺乳动物传染病监测提供新视角。2026-1-9 测序技术
衰老将小胶质细胞再填充转化为适应不良的重编程,加剧认知缺陷bioRxiv首次揭示衰老导致小胶质细胞再填充后出现异常基因表达模式(包括微胶质身份基因表达降低、免疫相关基因重编程和神经元基因去抑制),并发现该过程特异性损害老年小鼠的视觉辨别学习和注意力转换能力,为衰老相关认知障碍的治疗策略提供新视角2026-1-9 测序技术
环境DNA宏条形码技术在北极峡湾食物网高分辨率重建中的应用bioRxiv创新性采用eDNA宏条形码技术结合两种采样配置(鱼笼关联采样与拖网断面采样),通过同时分析线粒体COI基因(后生动物)和核糖体18S基因(原生生物),首次实现北极峡湾沿海与近海两个生态域的食物网结构差异量化,并建立基于四个食物网指标(物种丰富度、连接数、直接连接度、通用性)的生态网络分析框架。2026-1-9 测序技术