自然语言中的单细胞探索Nature Methods创新性地将自然语言处理技术与单细胞数据分析结合,开发了基于语言模型的单细胞数据探索方法,可能提升细胞异质性解析的效率和深度。2026-1-12 单细胞测序
氢/氘交换质谱分析核糖体-新生链复合物以在肽水平研究蛋白质生物生成Nature Protocols提出了一种利用氢-氘交换质谱技术分析核糖体-新生链复合物构象动态和相互作用蛋白的新策略,实现了在肽水平解析蛋白质生物生成过程的创新方法。2026-1-12 蛋白质组学
通过ISSAAC-seq进行单核染色质可及性与基因表达联合分析Nature Protocols创新性地开发了ISSAAC-seq技术,首次实现单核水平上染色质可及性与基因表达的同步检测,兼容板式和液滴两种单细胞分离平台,突破了传统方法在通量和分辨率上的限制。2026-1-12 测序技术 单细胞测序
Lin28依赖的TUT4介导前体let-7寡尿苷酰化的机制研究NAR通过冷冻电镜技术解析了TUT4与Lin28A及寡尿苷酰化前体let-7的复合物结构,揭示了LIM结构域与CM催化结构域协同作用机制,阐明了双链RNA区域的构象变化如何促进寡尿苷酰化过程。2026-1-12 核酸蛋白工具酶
着丝粒周围重复序列的转录暂停-回溯-重启循环通过依赖Rad52的ADR环形成导致染色体大规模重排NAR发现异染色质丢失后转录PBR循环通过R-loop积累引发染色体重排,揭示Rad52依赖的SSA机制将R-loop转化为ADR-loop并启动Polδ介导的BIR过程,阐明了表观遗传调控失衡导致基因组不稳定的分子机制。2026-1-13 测序技术 核酸蛋白工具酶
一种用于从粘性采样器中提取DNA的直接工作流程,用于真菌生物气溶胶的宏条形码分析bioRxiv开发了标准化的粘性薄膜DNA提取方法,实现了无需培养的ITS2宏条形码分析;揭示了真菌生物气溶胶的时空动态变化;提供了经济高效的环境生物气溶胶监测工具。2026-1-12 测序技术
双重补偿性基因重复赋能多聚体蛋白的定向进化bioRxiv创新性提出利用基因重复补偿代谢负担和自组装适应性缺陷的策略,突破传统定向进化方法的局限性,实现极端同源变体和强制异源多聚体的筛选,为高阶多聚体进化机制研究提供新范式。2026-1-12 蛋白质进化 基因编辑 合成生物学
利用EDEN基础模型家族设计AI可编程治疗药物bioRxiv创新点包括:1)开发基于环境基因组数据的EDEN基础模型(280亿参数),通过跨物种进化机制学习实现治疗设计;2)实现AI可编程基因插入技术(aiPGI),仅需30bp DNA序列即可设计新型重组酶;3)生成具有临床活性的抗菌肽库(97%有效率);4)构建包含94,000个合成宏基因组的高精度微生物组,扩展了生物多样性。2026-1-12 基因编辑 合成生物学 蛋白质进化
基于微小RNA空间分析评估BRCA1相关三阴性乳腺肿瘤药物疗效bioRxiv创新性提出空间miRNA分析框架,结合LDA和PCA算法实现肿瘤敏感性分层,并通过SSIM地图整合免疫微环境信息,首次建立耐药预测的空间分子分型体系2026-1-12 空间组学
CK2-FBXW11激酶-E3泛素连接酶级联作为代谢传感器调节色氨酸2,3-双加氧酶稳定性bioRxiv发现CK2-FBXW11激酶-E3连接酶级联通过磷酸化降解基序调控TDO2稳定性,揭示色氨酸通过结合外位点保护酶免受泛素化降解的机制,并阐明色氨酸特定化学基团在维持酶稳定性的结构基础。2026-1-12 基因编辑 蛋白质组学
机器学习实现纳米抗体的高效且有效的亲和力成熟bioRxiv创新性地利用机器学习加速纳米抗体亲和力成熟过程,通过单次排序的稀疏测序数据预测多轮筛选结果;发现线性模型在亲和力增强替换预测中优于深度学习模型,且具有可解释性优势;成功设计出3个亚纳摩尔级结合力的纳米抗体,其中最佳结合力提升2500倍。2026-1-12 测序技术 蛋白质进化
JNK1和FGF21调控的下丘脑-肝脏-骨骼肌轴介导腹腔注射奥氮平诱导的雄性小鼠胰岛素抵抗bioRxiv首次揭示腹腔注射奥氮平通过下丘脑-肝脏轴引发胰岛素抵抗的新机制,发现JNK1激活迷走神经抑制肝源性FGF21分泌,同时PTP1B缺失可完全阻断该代谢损伤,为个性化治疗提供潜在靶点。2026-1-12 基因编辑