运动性和非运动性李斯特菌物种在土壤中通过不同的基因组和生态策略实现广泛的地理分布bioRxiv首次揭示运动性细菌（L. welshimeri）通过增强运动性和宿主殖民能力实现长距离传播，而非运动性细菌（L. booriae）依赖基因组可塑性和代谢多样性适应局部环境，为理解微生物地理分布机制提供新视角。2026-1-9 测序技术
大西洋热液喷口虾类的高基因流动及生态型谱系的多次脊殖民化与不同共生关系bioRxiv创新性揭示了深海热液喷口虾类跨洋中脊的高基因流动现象，发现不同生态型谱系间存在显著遗传相似性，提出共生关系驱动种群快速扩张的假说，并重新定义了物种分类体系以反映形态可塑性与共生适应性关系。2026-1-9 测序技术
鸟类羽虱（Phthiraptera: Ischnocera）的系统基因组框架bioRxiv基于260个羽虱样本和25个外群的基因组数据，利用2395个核基因通过拼接和共祖方法构建高支持度的系统发育树，解决了形态学收敛导致的进化关系研究难题，并为未来比较研究提供框架。2026-1-9 测序技术
GraphESMStable：融合预训练序列模型与图神经网络的蛋白质稳定性预测深度学习框架bioRxiv创新性提出结合预训练蛋白质序列语言模型与图神经网络的跨模态融合框架，引入残差级交叉注意力机制实现多模态表征深度整合，开发可预测单点突变全景图的专用预测头和建模多点突变非加性效应的Epistasis Decoder模块。2026-1-9 蛋白质组学 蛋白质进化
利用空间信息指导的RNA速度与veloAgent解析和调控细胞动力学bioRxiv创新点包括：1) 首次将空间信息整合到RNA velocity框架中，提升动态推断准确性；2) 开发亚线性内存扩展算法，实现大规模空间数据高效分析；3) 引入虚拟扰动模块，可模拟调控干预对细胞命运的影响。2026-1-9 单细胞测序 空间组学
OKR-Cell：开放世界知识辅助的单细胞基础模型与鲁棒跨模态细胞-语言预训练bioRxiv创新点包括：1) 利用大语言模型结合检索增强生成技术，通过开放世界知识丰富细胞文本描述；2) 设计跨模态鲁棒对齐目标，结合样本可靠性评估、课程学习和耦合动量对比学习，提升模型对噪声数据的鲁棒性。2026-1-9 单细胞测序 测序技术
22q11.2微缺失位点中单倍体不足的线粒体基因之间的抑制性遗传相互作用定义了脑和心脏表型bioRxiv创新性揭示了MRPL40和SLC25A1基因的单倍体不足效应及其遗传互作机制，发现杂合突变小鼠的表型抑制现象，阐明了线粒体基因剂量失衡对组织发育和生理功能的调控网络。2026-1-9 蛋白质组学 基因编辑
RNA聚合酶III亚基Polr3a在颅面软骨和骨骼发育中的作用bioRxiv首次揭示Polr3a突变导致颅面发育缺陷的分子机制，发现tRNA转录减少和核糖体生物合成下降是关键因素，通过单细胞测序发现tp53上调但抑制无效，表明存在其他调控因子。2026-1-9 单细胞测序 核酸蛋白工具酶
细菌RNA聚合酶中NpnNs的5′端RNA帽结构分子机制Nature Chemical Biology创新性地揭示了细菌RNA聚合酶通过NpnNs形成非规范RNA帽结构的分子机制，发现一个核碱基以常规模式配对而另一个以反向沃森-克里克模式配对的特殊现象，为理解转录起始提供了新视角。2026-1-9 核酸蛋白工具酶
ASXL1 K351单泛素化独特的粘附效应刺激PR-DUB活性Nature Chemical Biology发现泛素通过增强Polycomb抑制性去泛素化酶复合物亚基间相互作用，以变构方式激活其去泛素化功能，揭示了泛素在蛋白质复合物调控中的新型作用机制2026-1-9 蛋白质组学 核酸蛋白工具酶
去乙酰化酶非依赖性HDAC1冷凝体定义替莫唑胺在胶质母细胞瘤中的反应Nature Chemical Biology发现HDAC1通过形成去乙酰化酶非依赖性冷凝体招募CCCTC结合因子重塑染色质，导致替莫唑胺耐药；利用Resminostat破坏冷凝体可恢复药物敏感性，为胶质母细胞瘤治疗提供新靶点2026-1-9 核酸蛋白工具酶
功能性无序蛋白质的定向进化Nature Chemical Biology开发了基于多种选择策略的定向进化方法，实现了合成无序蛋白质在活细胞中形成具有特定功能的凝聚物2026-1-9 蛋白质进化 合成生物学
