DEPower:基于DESeq2的近似功效分析bioRxiv创新性地将DESeq2统计框架与功效分析结合,开发了首个针对单细胞和bulk RNA-seq实验的样本量计算工具,突破传统模拟方法的局限性,并通过网页工具实现普及化应用。2026-2-9 测序技术 单细胞测序
蛋白质组学和单细胞转录组学鉴定LRP1作为不典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤的诊断生物标志物bioRxiv创新性结合单细胞测序与蛋白质组学技术发现LRP1作为新型诊断标志物,其敏感性(90%)和特异性(73%)显著优于现有标志物CD10;联合LTBP2使用后特异性提升至93%,为两类肿瘤的精准诊断提供新方案。2026-2-9 蛋白质组学 单细胞测序
Toll样受体5通过脂质和鞭毛蛋白诱导的肝细胞损伤信号传导驱动代谢功能障碍相关性脂肪性肝炎bioRxiv首次揭示TLR5通过脂质损伤和鞭毛蛋白双途径诱导肝细胞损伤,发现TLR5抑制可阻断肝星状细胞活化并减少胶原沉积,为MASH纤维化提供新靶点。2026-2-7 单细胞测序
单细胞多组学方法揭示从胚胎到成年神经干细胞的渐进、空间调控的表观遗传和转录过渡bioRxiv创新性地整合单细胞空间组学、转录组学和表观组学技术,发现神经干细胞状态转变存在时空分离的渐进过程,首次揭示E17/18阶段存在过渡前体状态,并证明成年NSC的生成与产后细胞类型生成在空间上独立发生。2026-2-7 单细胞测序 空间组学
ProtoCloud:一种用于单细胞分析的原型自解释模型bioRxiv1. 提出首个结合原型嵌入与自解释机制的单细胞注释模型;2. 通过原型相似性量化机制实现错误标注细胞的自动修正;3. 采用数据增强策略显著提升稀有细胞类型识别能力;4. 可解释性分析可发现新型细胞标记基因。2026-2-6 单细胞测序
转录因子结合的位置语法在植物中划分发育与应激反应调控bioRxiv创新性整合保守的转录因子结合位点(TFBS)与单细胞染色质可及性数据,揭示TFBS位置与细胞类型特异性基因表达的关联;发现近启动子区TFBS参与全组织应激响应,而远端启动子区TFBS与胚胎发育相关基因调控相关。2026-2-6 单细胞测序
一种可扩展、与图谱对齐且可解析克隆型的单细胞转录组学模块化转录富集策略bioRxiv创新点包括:1) TRTL方法通过模块化设计实现从几十到数千基因的灵活扩展;2) 保留逆转录步骤可捕获高变转录本(如TCR/BCR);3) 结合组合索引RNA测序实现低深度下精准细胞注释;4) 开发targeted-sci-Plex协议同步解析T细胞命运轨迹和克隆型。2026-2-6 测序技术 单细胞测序
每细胞都重要:单细胞分辨率揭示番茄根对氮的响应bioRxiv首次通过单细胞多组学分析揭示番茄根部细胞类型特异性氮响应机制,构建了氮条件下的基因调控网络,为提高园艺作物氮利用效率提供基因资源。2026-2-7 单细胞测序 测序技术
稳态和再生状态下成年脊椎动物全身单细胞图谱bioRxiv创新性地结合区域分层单细胞RNA测序与全身空间转录组学技术,首次在成年脊椎动物中实现全身细胞类型的空间定位与基因表达动态解析,揭示了神经前体细胞区域特异性、成体结缔组织保守基因程序及跨物种神经细胞进化保守性。2026-2-5 单细胞测序 空间组学
跨小鼠、猕猴和人类的脊髓细胞类型共识图谱bioRxiv创新性整合单核基因表达、染色质可及性和空间转录组数据构建跨物种图谱;首次生成细胞类型引导的脊髓解剖图谱;发现灵长类运动神经元亚型特异性基因表达模式;通过跨物种增强子分析揭示保守的转录因子调控逻辑。2026-2-5 单细胞测序 空间组学
哺乳动物皮肤中的rete嵴通过进化上不同的机制形成Nature通过跨物种单细胞和空间转录组学技术,发现表皮BMP信号是rete嵴形成的必要机制,揭示了毛发密度丧失和伤口愈合的分子基础2026-2-4 单细胞测序 空间组学 测序技术