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通过同义密码子约束掩码推进密码子语言模型

NAR
提出SynCodonLM模型,通过同义密码子约束掩码机制分离密码子层级与蛋白质层级语义,基于核酸特性聚类密码子,显著提升DNA特征相关基准测试表现,推动合成生物学中的序列设计与生物过程研究。
2026-2-25
合成生物学
蛋白质组学
蛋白质进化

空间集中腺嘌呤碱基编辑器有效纠正少突胶质细胞中的PLP1突变

NAR
开发了空间集中ABE(cABE)策略,通过SunTag系统实现TadA*在基因组靶点的局部富集,结合eNme2-C Cas9生成AAV兼容的cABE-2.0,其形成的液-液相分离核斑点显著提升编辑效率并降低脱靶效应,成功修复PLP1突变并恢复髓鞘化功能。
2026-2-25
基因编辑
核酸蛋白工具酶

SSB介导的Argonaute活性增强触发细菌SOS丝状化

NAR
发现SSB与Argonaute的相互作用机制,揭示其通过调控DNA损伤修复和细胞分裂检查点引发细菌丝状化的新型生理功能,为合成生物学提供潜在工具。
2026-2-25
核酸蛋白工具酶
合成生物学

hnRNPA2B1通过招募APOBEC3B诱导HBV cccDNA降解

NAR
发现hnRNPA2B1通过识别cccDNA的G-四链体结构招募APOBEC3B诱导DNA突变和降解,揭示HBV通过HBx蛋白介导hnRNPA2B1泛素化逃逸该机制的新病毒-宿主互作模式
2026-2-25
蛋白质组学
核酸蛋白工具酶

通过敲除U11 snRNA基因抑制次要剪接体导致小鼠生精过程中的多种缺陷

NAR
首次揭示次要剪接体在哺乳动物生精过程中的关键调控作用,发现MIGs基因在脊索动物中的保守性及谱系特异性变化,通过基因敲除和RNA测序技术明确次要剪接体缺陷导致的染色体联会异常、端粒形态改变及精子生成障碍等多层级缺陷
2026-2-25
测序技术
基因编辑

基于深度批量贝叶斯优化的NAND混合核糖开关的迭代设计

NAR
创新性提出结合高通量体内筛选与深度贝叶斯优化的机器学习框架,通过集成神经网络代理模型实现混合核糖开关的NAND逻辑功能优化,达到接近数字逻辑的性能表现。
2026-2-27
合成生物学

用于定量紫外线照射细胞中核苷酸切除修复寡核苷酸产物的竞争性免疫分析平台开发

NAR
创新性开发了基于微孔板的竞争性免疫分析平台,通过聚乙二醇分离技术有效区分sedDNAs与大分子DNA污染,结合固相UV照射寡核苷酸和损伤特异性抗体,实现对(6-4)PP和CPD修复产物的高灵敏度检测(较传统方法分别提升22倍和7倍)。
2026-2-27
抗体核酸偶联

AML相关核磷蛋白NPM1 C端的多点磷酸化调控蛋白稳定性、DNA结合及电荷阻塞驱动的相分离

NAR
揭示NPM1 C端DNA结合域的多点磷酸化通过改变电荷分布和结构动态,调控其DNA结合能力及相分离特性,为NPM1突变导致AML的分子机制提供新解释。
2026-2-27
蛋白质组学

一种新型双导向CRISPR–Cas13策略提高单核苷酸变异检测特异性

NAR
开发了首个双引导RNA系统(dcrRNA和dtracrRNA)用于Cas13,通过协同识别靶标显著提升特异性并降低脱靶活性,成功应用于SARS-CoV-2检测、KRAS突变区分及利什曼病序列鉴别。
2026-2-27
基因编辑
核酸蛋白工具酶

利用不稳定双顺反子荧光蛋白报告系统进行CRISPR/Cas9筛选揭示PABPN1是替代性多聚腺苷酸化调控枢纽

NAR
创新性开发了不稳定双顺反子荧光蛋白报告系统(dBFPR)提升APA检测灵敏度,并整合CRISPR/Cas9与流式细胞术建立高通量筛选平台,发现PABPN1作为APA调控网络的核心枢纽蛋白
2026-2-27
基因编辑
合成生物学
蛋白质组学

RAPseq实现大规模RNA结合蛋白与RNA相互作用的鉴定并揭示转录后基因调控的关键机制

NAR
开发无需抗体和合成探针的体外测序方法RAPseq,可大规模分析天然RNA结合;发现非典型RBP的新功能;揭示物种特异性结合偏好;开发组合检测(co-RAPseq)和修饰敏感检测(mod-RAPseq)方法。
2026-2-27
测序技术
蛋白质组学

人类前60S复合物核成熟的不同步骤需要包括GNL3L在内的GTP酶的活性

NAR
1. 首次发现GNL3L作为新GTP酶参与人类前60S核糖体成熟过程;2. 揭示GNL3L的GTP水解活性对前rRNA加工和60S亚基组装的必要性;3. 确定GNL3L与前rRNA的直接相互作用位点及其对细胞增殖的调控作用。
2026-2-27
核酸蛋白工具酶
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一个普通的干饭人🍚
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