AlphaFind v2:跨结构背景的AlphaFold数据库和TED结构域相似性搜索bioRxiv提出AlphaFind v2工具,通过结合蛋白嵌入预筛选和US-align优化,实现大规模结构数据库的高效搜索;支持全蛋白链搜索、pLDDT稳定性过滤、TED结构域搜索及多结构域组合搜索等多种模式,提升结构比对的生物学相关性与实用性。2026-3-12 蛋白质组学 蛋白质进化
蛋白质表面的联合几何-化学距离bioRxiv创新性提出IFACE框架,通过概率耦合内在几何与化学场实现蛋白质表面对应,构建整合结构与理化差异的联合距离指标,有效区分构象可变性与结构分歧,并揭示跨蛋白质功能相关相互作用位点。2026-3-12 蛋白质组学
激素响应性牛输卵管类器官重现天然输卵管分泌物并增强精子获能bioRxiv创新性地建立了具有激素响应特性的牛输卵管类器官,成功模拟了体内输卵管的分泌功能;通过多组学分析揭示了不同激素条件下转录组和蛋白质组的动态变化;证实类器官分泌物可增强精子获能,为研究生殖过程及辅助生殖技术提供新平台。2026-3-12 蛋白质组学 测序技术
重建美国北部黑腿蜱(Ixodes scapularis)的人口历史bioRxiv创新性地整合三个独立基因组数据集与近似贝叶斯计算模型,揭示了黑腿蜱在北美北部的多群体独立演化历史,发现其当前生态扩张源于不同古群体的遗传祖先而非单一来源,为媒介传播疾病管理提供新视角。2026-3-12 测序技术
在α1β2γ2 GABAA受体的α1亚基M2-M3连接区引入脯氨酸可解除通道激活的分子刹车bioRxiv创新性揭示了GABAA受体中脯氨酸在M2-M3连接区的双重调控作用:1) 在α1亚基引入脯氨酸可增强GABA敏感性和自发通道活性;2) 在β2亚基替换脯氨酸可调节通道激活效率;3) 首次阐明不同亚基中脯氨酸对通道门控的差异化影响机制。2026-3-12 基因编辑
TSC2作为miR-514b-3p的转录因子并通过细胞核调节PI3K-AKT-MTOR通路bioRxiv首次揭示TSC2的核内转录调控功能,发现其作为miR-514b-3p的转录因子通过NLS依赖机制调控MIR514B启动子活性,建立TSC2-miR-514b-3p-TSPAN9调控轴,并阐明该轴与PI3K-AKT-MTOR通路的串扰机制,同时发现AKT通过调控TSC2核定位影响该轴的上游调控。2026-3-12 测序技术
基线细胞状态决定KRAS突变体在胰腺癌细胞中的分子影响bioRxiv创新性地发现胰腺癌细胞中KRAS突变体的分子影响主要由基线细胞状态决定而非突变类型,通过整合转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析建立了KRAS信号的多组学资源,揭示了不同KRAS突变体在胰腺癌中的共性分子特征。2026-3-12 蛋白质组学 基因编辑 测序技术
在花园睡鼠大脑皮层中,所有冬眠主要阶段都存在特定的转录程序bioRxiv首次系统揭示冬眠大脑皮层各阶段特异性的转录调控网络,发现冬眠进展期(TE→TL)和觉醒过渡期(TL→AE)存在显著的基因表达重编程,阐明代谢抑制与快速恢复的分子机制,为神经适应性研究提供新模型2026-3-12 测序技术
种群历史塑造森林树木对气候变化的脆弱性bioRxiv首次在多个树种中同步评估不同种群历史对气候适应性的影响,发现遗传隔离与适应潜力负相关,揭示基因流动对缓解气候适应性劣化的关键作用机制2026-3-12 测序技术
ChromSMF:在多千碱基DNA分子上整合分析组蛋白修饰、蛋白质-DNA相互作用和DNA甲基化bioRxiv创新性地整合抗体引导的Hia5酶定位、M.CviPI足迹分析和纳米孔测序技术,首次实现单分子层面同时检测组蛋白修饰、蛋白质-DNA相互作用、DNA甲基化及序列变异;开发了针对单倍型的多层表观遗传调控计算分析框架。2026-3-12 测序技术 核酸蛋白工具酶 抗体核酸偶联
条件激活Cas13在天然VI-A型CRISPR宿主中强制溶源性Nature Microbiology发现Cas13的条件激活机制可调控噬菌体生命周期,通过维持溶源状态避免裂解风险,同时允许有益原噬菌体整合,为CRISPR系统在宿主防御中的功能提供了新见解。2026-3-10 基因编辑 核酸蛋白工具酶
异源寡聚化驱动真核过氧化物酶的结构可塑性Nature Chemical Biology发现不同生物来源的过氧化物酶能形成异源混合复合物,而非传统认为的同源组装,揭示了蛋白质复合物结构可塑性与稳定性的新调控机制,颠覆了细胞内过氧化物酶组装的认知范式。2026-3-10 蛋白质组学 蛋白质进化