GRAVITY:基于动态基因调控网络增强的RNA速度建模用于轨迹推断与生物发现bioRxiv创新点包括:1) 首次将基因调控动态整合到转录动力学推断中;2) 提出两阶段优化策略提升轨迹推断准确性;3) 发现胚胎大脑发育中的新型终端细胞状态L5/L6;4) 可系统模拟调控扰动对细胞速度的影响。2026-2-2 单细胞测序
前向编程识别人多能干细胞衍生内皮细胞中血脑屏障特性的诱导剂bioRxiv创新性地利用单细胞RNA测序结合前向编程技术,筛选出调控血脑屏障特性的关键转录因子组合,通过多转录因子协同作用显著提升内皮细胞的屏障功能,为血脑屏障发育机制研究和神经血管疾病模型构建提供新工具。2026-2-3 单细胞测序
局部适应的遗传结构具有历史依赖性bioRxiv创新性地通过模拟揭示了生态与遗传参数互作对局部适应的影响机制,发现种群扩张历史会显著改变适应性等位基因的数量和频率,且等位基因年龄可调节群体结构对基因-环境关联分析的干扰效应。2026-2-3 空间组学 蛋白质进化
单细胞转录和染色质状态图谱揭示人类大脑中的调控程序bioRxiv创新性整合单细胞转录组、染色质可及性、DNA甲基化、3D基因组结构和空间转录组数据,构建跨18个脑区的多模态图谱;注释超50万个调控元件,解析细胞类型特异的染色质状态,建立增强子-靶基因网络,并通过跨物种比较揭示大脑调控保守性与多样性。2026-2-3 单细胞测序 空间组学
线粒体DNA异质性通过线粒体翻译控制肿瘤免疫重编程bioRxiv发现线粒体DNA异质性通过调节线粒体翻译和S100A8/A9分泌,重塑肿瘤免疫微环境;揭示中度异质性促进免疫逃逸而高异质性抑制肿瘤生成的双重机制;发现LARS2-线粒体翻译-S100A8/A9轴是潜在治疗靶点。2026-2-3 蛋白质组学 核酸蛋白工具酶
母胎免疫冲突导致神经发育障碍小鼠模型中的男性特异性损伤bioRxiv首次揭示母体免疫激活(MIA)通过诱导胎盘海绵状滋养层细胞的促炎基因程序和结构破坏,导致男性胚胎特异性发育异常的分子机制,并发现IL-6在该过程中的关键作用。2026-2-3 单细胞测序
合成生殖颗粒揭示Vasa/DDX4在RNA定位和翻译激活中的直接作用bioRxiv开发了合成生殖颗粒技术,发现Vasa/DDX4是RNA定位和翻译激活的核心因子;通过体外重构实验揭示了RBD支架与Vasa解旋酶构成的两组件模块机制;证明Vasa在mRNA招募与局部翻译激活中的必要且充分作用。2026-2-3 合成生物学 核酸蛋白工具酶
多倍体心肌细胞定义哺乳动物心脏中的疾病特异性转录状态bioRxiv首次整合单核和空间多组学技术跨物种解析心肌细胞异质性,发现多倍体心肌细胞特有的代谢重编程和染色质重塑转录程序,并鉴定TNIK为心衰治疗新靶点2026-2-3 单细胞测序 空间组学
合成复制起点工程化质粒Nature Communications重构天然pMB1复制起点,创建具有可定制拷贝数的质粒,并通过合成RNA调控器实现独立的拷贝控制,突破天然复制机制的限制。2026-2-2 合成生物学
利用蛋白质语言模型定制CRISPR-Cas PAM特异性Nature Biotechnology创新性地将蛋白质语言模型应用于CRISPR-Cas系统,通过机器学习方法优化PAM序列识别规则,突破传统Cas酶的PAM序列限制,显著提升基因编辑的靶向精度和适用范围。2026-2-2 基因编辑 蛋白质组学 核酸蛋白工具酶