跨连接组的神经元线粒体空间与形态组织 | ScienceScience首次通过果蝇电子显微镜连接组数据，揭示神经元中线粒体形态与空间分布的定量规律，阐明线粒体组织与神经功能的关系2025-12-11 空间组学
弥合平面空间转录组学到三维细胞图谱的维度差距Nature Methods提出SpatialZ方法通过生成虚拟单细胞空间转录组学切片，解决了从平面实验数据重建三维细胞图谱的维度差异问题，实现了跨组织类型的高效三维重建。2025-12-31 空间组学 单细胞测序
SCALE：空间组学数据中无监督多尺度领域识别NAR提出无监督算法SCALE，结合深度学习图表示学习与熵搜索算法，实现空间转录组数据中多尺度功能领域的层级识别，跨平台验证显示其性能优于现有方法191.1个百分点。2026-1-6 空间组学 单细胞测序
微环境感知的空间建模用于准确推断细胞身份NAR提出MEcell方法，首次将空间上下文显式纳入细胞身份建模，通过自动调整空间信息权重提升推断准确性；在90个模拟数据和7个真实空间转录组数据集验证中表现最优，揭示微环境对细胞身份定义的关键作用。2026-1-6 空间组学 单细胞测序
恶性疟原虫血阶段顶极环的必需功能bioRxiv首次揭示PfAPR1在顶极环基部定位的分子机制，发现其调控子细胞分割和微管组织的关键作用；通过iU-ExM技术解析顶极环生物合成过程；鉴定多个新型顶极环相关蛋白，明确顶极环作为抗疟靶点的分子基础。2026-1-8 基因编辑 空间组学 蛋白质组学
高内容数字器官的单细胞分辨率计算生成Nature Methods创新性地通过计算方法从稀疏采样的平面空间转录组数据生成虚拟切片，构建了3800万细胞的小鼠大脑图谱，实现了组织切片间间隙的弥合与三维分子景观的连续性保持。2026-1-6 空间组学 单细胞测序
CellMap：空间转录组学中细胞景观的精确映射NAR创新性整合种子基因共线性分析、随机森林模型和线性分配算法，实现单细胞分辨率的空间转录组学定位，跨平台跨组织类型基准测试显示性能优于现有方法2026-1-8 空间组学 单细胞测序
利用SPLISOSM从空间转录组学数据中映射异构体和调控机制Nature Biotechnology开发了基于空间转录组学数据的SPLISOSM方法，能够高效识别基因异构体使用差异并解析其调控机制，突破了传统方法在空间分辨率和统计效力上的局限性。2026-1-5 空间组学 测序技术
哺乳动物小脑中AMPA受体-TARP复合物的结构与组织 | ScienceScience首次揭示AMPA受体与TARP蛋白在小脑不同细胞类型中的复合物结构差异，阐明其空间组织规律与功能特化机制，为理解突触传递与胶质细胞信号调控提供结构基础。2025-12-11 蛋白质组学 空间组学
空间条形码技术揭示邻近标记的反应半径及接触依赖机制Nature Chemical Biology开发DNA纳米标尺平台精确测量TurboID和APEX2的标记半径，发现其接触依赖机制，重新定义邻近标记酶学，并展示DNA纳米技术在纳米级空间解析酶反应性中的潜力。2025-12-24 空间组学 合成生物学 核酸蛋白工具酶
弥合平面空间转录组学与三维细胞图谱之间的维度差距Nature Methods提出SpatialZ方法生成虚拟单细胞空间转录组切片，通过实验测得的切片数据高效构建组织的三维细胞图谱，解决了平面数据向三维结构转换的精度与效率问题。2025-12-31 空间组学 单细胞测序 测序技术
