U2AF2通过RS结构域依赖的方式调控核斑点邻近区域的可变剪接NAR1. 揭示U2AF2的RS结构域通过调控蛋白质相互作用和核定位影响可变剪接;2. 发现U2AF2的局部浓度限制导致核斑点邻近区域剪接异常;3. 通过邻近标记技术扩展了U2AF2的功能网络,包括染色质修饰和RNA甲基化相关蛋白;4. 首次明确U2AF2的磷酸化位点对剪接调控的必要性。2026-2-28 空间组学 蛋白质组学
组织组成在墨西哥钝口螈肢体再生过程中塑造差异化的骨骼整合策略bioRxiv1. 揭示骨骼组织组成差异调控破骨细胞介导的骨骼吸收机制;2. 发现钙化区域截肢特异性激活RANKL和Loc138491483/Ccl24-like基因表达;3. 证明趋化因子Loc138491483/Ccl24-like可诱导非吸收区域破骨细胞聚集;4. 首次发现顶端外胚层帽转录组谱随损伤组织类型动态调整。2026-2-27 空间组学 测序技术
社交功能障碍和催产素介导恢复小鼠模型中小胶质细胞的转录组景观bioRxiv首次揭示胚胎期VPA暴露导致PVH小胶质细胞转录异常,发现空间转录组学可解析微胶质亚型分布变化,并证实催产素神经元与小胶质细胞存在双向调控机制,为社交障碍的神经免疫机制提供新视角。2026-2-27 单细胞测序 空间组学
缺氧及相关的酸中毒在胶质母细胞瘤中引发细胞类型特异性的髓系反应bioRxiv创新性整合循环免疫组化、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示缺氧微环境中巨噬细胞与小胶质细胞的代谢适应差异:MDM通过碳酸酐酶介导的pH缓冲机制存活并转向免疫抑制状态,而小胶质细胞则因缺乏补偿机制导致功能失衡,阐明代谢适应是塑造GBM免疫架构的关键因素。2026-2-28 单细胞测序 空间组学
单细胞空间蛋白质组学揭示衰老标志物之间的分子相互关联bioRxiv首次构建酵母复制衰老的全蛋白质组单细胞亚细胞图谱,发现衰老标志物间存在空间重塑的分子联系;揭示核仁核糖体生物生成紊乱、蛋白质稳态下降和线粒体功能障碍先于其他衰老标志物出现;发现91.6%的人类同源蛋白在人类衰老中发生类似变化。2026-2-28 单细胞测序 空间组学 蛋白质组学
Ornithodoros phacochoerus蜱虫中的微生物群落:空间结构及非洲猪瘟病毒传染状态的影响bioRxiv首次揭示了Ornithodoros phacochoerus蜱虫微生物群落的低多样性特征(仅含主要共生菌Francisella-like endosymbiont和次要共生菌Rickettsiella),发现其微生物群落存在显著的空间结构特征,且非洲猪瘟病毒传染状态与微生物群落组成无显著关联,这与硬蜱研究结果存在差异。2026-2-26 测序技术 空间组学
毫米级秸秆-土壤界面处空间解析的反硝化与甲烷及砷酸盐氧化耦合PNAS揭示了秸秆分解在毫米级空间尺度上形成微生物活动热点,首次发现反硝化作用与甲烷/砷酸盐氧化的耦合机制,为理解农业实践对温室气体排放和砷迁移的影响提供新视角。2026-2-19 空间组学
三维DNA显微术用于三维空间转录组映射Nature Protocols通过DNA序列编码空间信息,实现无需模板的三维基因表达模式重建,突破传统二维空间成像的技术限制,可在完整样本中解析基因表达的空间分布。2026-2-24 空间组学 合成生物学
深度学习框架ChIANet在不同功能背景下预测蛋白质介导的染色质结构bioRxiv提出多模态深度学习框架ChIANet,首次实现仅依赖蛋白质结合图谱预测染色质接触图和环结构;整合Transformer长距离建模与多任务学习,首次揭示不同蛋白质(CTCF/Cohesin/RNAPII)介导的染色质结构在保守性与可塑性上的差异;首次发现RNAPII介导的染色质环与癌症中ecDNA的强关联。2026-2-25 蛋白质组学 空间组学
Myc抑制触发GM-CSF驱动的胰腺肿瘤退行bioRxiv创新性揭示Myc失活通过GM-CSF启动肿瘤退行机制,发现cDC1细胞作为关键效应器,提出PDAC退行的新型治疗框架,阐明肿瘤细胞与微环境的动态互作模式。2026-2-25 空间组学 基因编辑
STRATA:空间调控子场理论揭示人类皮肤耦合架构及其在黑色素瘤中的均质化bioRxiv提出STRATA方法,通过微分几何框架构建连续调控子活动场,量化转录因子程序间的局部共调控关系,并发现黑色素瘤微环境通过降低调控子耦合方差和相界强度实现组织均质化。2026-2-25 空间组学