X-CODE：一种用于多平台克隆追踪和空间表型分析的双RNA条形码系统bioRxiv创新点包括：1) 双RNA条形码系统（长RNA条形码+短测序条形码）实现跨测序、流式细胞术和空间成像平台的克隆追踪整合；2) 开发空间RNA条形码读取方法（基于Akoya PhenoCycler-Fusion协议）；3) 与MALDI质谱成像兼容实现克隆与代谢信息共注册；4) 在前列腺癌模型中揭示克隆架构及去势抵抗的表型/代谢可塑性机制。2026-2-11 测序技术 空间组学 抗体核酸偶联
早期灵长类动物胚胎着床期的高分辨率空间转录组和蛋白质组分析bioRxiv首次在早期灵长类原肠胚中实现高分辨率空间转录组与蛋白质组联合分析，构建了包含6类主要细胞群体的分子图谱，揭示了羊膜命运决定的WNT信号通路关键作用，并发现多个谱系亚型及调控网络。2026-2-11 空间组学 蛋白质组学
空间转录组学揭示由肿瘤微环境驱动的浸润性小叶癌亚型PNAS首次利用空间转录组学技术解析浸润性小叶癌的肿瘤微环境空间结构，发现其微环境驱动的分子亚型，为理解该疾病独特的生物学特性和临床特征提供新视角。2026-2-4 空间组学
肌球蛋白调节轻链磷酸化的空间控制调节心脏粗肌丝机械感知PNAS揭示了肌球蛋白调节轻链磷酸化的空间调控机制，阐明其在心脏粗肌丝机械感知中的关键作用，为理解心脏收缩力调节提供了新视角。2026-2-5 蛋白质组学 空间组学
C9orf72重复扩增重塑ALS中的三维染色质景观bioRxiv发现C9orf72-STR扩增通过诱导神经元特异性染色质环形成，导致转录组失调；提出RNA-DNA相互作用驱动异常染色质环形成的机制；揭示核拓扑改变与基因失调在神经退行性疾病中的关联。2026-2-11 空间组学
DIA-CLIP：一种用于零样本DIA蛋白质组学的通用表示学习框架bioRxiv1. 提出跨模态表示学习框架，实现肽段序列与质谱信号的统一表征；2. 通过双编码器对比学习与编码器-解码器架构，无需运行特定训练即可完成高精度零样本PSM推断；3. 在单细胞和空间蛋白质组学中显著提升蛋白质鉴定率（+45%）并降低错误发现率（-17%）。2026-2-11 蛋白质组学 单细胞测序 空间组学
高灵敏度和高选择性的下一代基于FRET的PKA生物传感器bioRxiv开发了第六代AKAR6 FRET传感器，通过优化供体-受体对和传感器骨架显著提升灵敏度与选择性；利用激酶图谱数据设计核特异性变体；揭示生长因子在不同亚细胞区室（如高尔基体）的PKA信号差异；适用于多种实验技术（流式细胞术、荧光寿命成像等）。2026-2-9 合成生物学 蛋白质进化 空间组学
表达人TLR8的狼疮小鼠早期胎盘发育缺陷及妊娠丢失bioRxiv首次建立表达人TLR8的SLE小鼠妊娠丢失模型，揭示TLR8通过激活胎盘单核细胞和招募细胞毒性T细胞导致胎盘损伤的机制，并利用空间转录组技术明确子宫自然杀伤细胞丢失与炎症聚集的空间分布特征。2026-2-9 空间组学 测序技术
空间蛋白质组学揭示前额叶回路在社会情绪行为中的多样性bioRxiv1. 开发了投影特异性空间蛋白质组学方法；2. 发现mPFC六个投射通路存在突触分子多样性；3. 首次发现BLTP2蛋白在mPFC→BLA通路中的关键作用；4. 揭示BLTP2通过招募Neurexin 1调控突触组装的分子机制。2026-2-8 空间组学 蛋白质组学
通过等离子体加热激活DNA探针信号交换的多重细胞和组织成像bioRxiv创新性地利用等离子体加热触发DNA热探针的信号交换反应，突破传统荧光成像3-5个靶标的限制，通过5次光热脉冲在单荧光通道内实现多重靶标快速成像（30秒/轮），可解析亚细胞结构和毫米级组织空间分布。2026-2-7 空间组学 核酸蛋白工具酶
单细胞多组学方法揭示从胚胎到成年神经干细胞的渐进、空间调控的表观遗传和转录过渡bioRxiv创新性地整合单细胞空间组学、转录组学和表观组学技术，发现神经干细胞状态转变存在时空分离的渐进过程，首次揭示E17/18阶段存在过渡前体状态，并证明成年NSC的生成与产后细胞类型生成在空间上独立发生。2026-2-7 单细胞测序 空间组学
早发性淀粉样蛋白β在5xFAD小鼠海马CA1区的出现引发神经元过度兴奋、线粒体退化和树突复杂性丧失bioRxiv首次揭示5xFAD小鼠在淀粉样斑块形成前即出现突触过度兴奋、线粒体功能障碍和树突结构改变的早期病理特征，并通过空间转录组学技术证明海马亚区存在分子脆弱性差异，为阿尔茨海默病早期干预提供了新靶点。2026-2-6 空间组学
