Ornithodoros phacochoerus蜱虫中的微生物群落:空间结构及非洲猪瘟病毒传染状态的影响bioRxiv首次揭示了Ornithodoros phacochoerus蜱虫微生物群落的低多样性特征(仅含主要共生菌Francisella-like endosymbiont和次要共生菌Rickettsiella),发现其微生物群落存在显著的空间结构特征,且非洲猪瘟病毒传染状态与微生物群落组成无显著关联,这与硬蜱研究结果存在差异。2026-2-26 测序技术 空间组学
毫米级秸秆-土壤界面处空间解析的反硝化与甲烷及砷酸盐氧化耦合PNAS揭示了秸秆分解在毫米级空间尺度上形成微生物活动热点,首次发现反硝化作用与甲烷/砷酸盐氧化的耦合机制,为理解农业实践对温室气体排放和砷迁移的影响提供新视角。2026-2-19 空间组学
三维DNA显微术用于三维空间转录组映射Nature Protocols通过DNA序列编码空间信息,实现无需模板的三维基因表达模式重建,突破传统二维空间成像的技术限制,可在完整样本中解析基因表达的空间分布。2026-2-24 空间组学 合成生物学
深度学习框架ChIANet在不同功能背景下预测蛋白质介导的染色质结构bioRxiv提出多模态深度学习框架ChIANet,首次实现仅依赖蛋白质结合图谱预测染色质接触图和环结构;整合Transformer长距离建模与多任务学习,首次揭示不同蛋白质(CTCF/Cohesin/RNAPII)介导的染色质结构在保守性与可塑性上的差异;首次发现RNAPII介导的染色质环与癌症中ecDNA的强关联。2026-2-25 蛋白质组学 空间组学
Myc抑制触发GM-CSF驱动的胰腺肿瘤退行bioRxiv创新性揭示Myc失活通过GM-CSF启动肿瘤退行机制,发现cDC1细胞作为关键效应器,提出PDAC退行的新型治疗框架,阐明肿瘤细胞与微环境的动态互作模式。2026-2-25 空间组学 基因编辑
STRATA:空间调控子场理论揭示人类皮肤耦合架构及其在黑色素瘤中的均质化bioRxiv提出STRATA方法,通过微分几何框架构建连续调控子活动场,量化转录因子程序间的局部共调控关系,并发现黑色素瘤微环境通过降低调控子耦合方差和相界强度实现组织均质化。2026-2-25 空间组学
果蝇中三维基因组重组织预示合子基因组激活Nature Genetics开发了低输入Micro-C技术Pico-C,发现三维基因组动态重构先于合子基因组激活,揭示了染色质空间结构变化与基因组激活的时空关联2026-2-24 测序技术 空间组学
局部肿瘤微环境生态位与人胶质母细胞瘤生存率和免疫治疗反应的相关性bioRxiv创新性整合空间转录组学、单细胞RNA测序和组织学数据,揭示胶质母细胞瘤微环境的空间异质性,发现不同生态位类型与患者生存率及免疫治疗反应的显著关联,为精准治疗提供新靶点。2026-2-23 单细胞测序 空间组学
溺亡于沙海:超干旱阿塔卡马沙漠中Tillandsia的沙面生长bioRxiv创新性地揭示了Tillandsia植被与沙土相互作用的机制,通过多区域对比发现植被对沙质基质的塑造作用;首次结合群体基因组数据与空间环境参数,阐明极端干旱环境下物种适应性演化规律;提出风沙动力学与生物过程耦合维持生态系统稳定性的新理论框架。2026-2-24 空间组学 测序技术
超越对齐:多模态细胞基础模型需要协同整合bioRxiv提出协同信息得分(SIS)量化跨模态信息增益,揭示对齐目标仅能检测线性冗余而无法捕捉非线性协同状态,证明复杂任务需要协同整合而非简单对齐,并通过空间转录组学基准验证了协同整合的必要性。2026-2-24 空间组学
空间电离辐射触发橄榄石表面肽和有机磷酸盐的形成Nature Communications创新性揭示了电离辐射在太空环境中可驱动前生物有机分子(如二肽、核糖磷酸化产物)在橄榄石表面的固态缩合反应,为理解星际有机物形成机制和生命起源提供了新视角。2026-2-23 空间组学