MERFISH 2.0：一种用于多种组织类型的超灵敏单细胞空间转录组学成像化学技术bioRxiv开发了MERFISH 2.0技术，通过优化成像化学方法显著提升RNA检测灵敏度（较1.0版本提高8倍），特别适用于处理降解的存档组织（如FFPE样本），并能揭示更多细胞群体和细胞间互作，增强空间分析能力。2026-3-6 空间组学 单细胞测序
CLIM-TIME识别T细胞治疗反应的转移性微环境调节因子Cell开发了高通量扰动映射平台，揭示肿瘤抑制基因丢失与转移生态位的空间关联，发现LOXL2是调控免疫抑制性转移微环境的关键因子，其抑制可增强T细胞浸润和治疗效果。2026-2-11 空间组学
全脑少突胶质细胞组织、生成及髓鞘损伤的映射Cell构建了跨衰老、疾病、性别和品系的全脑少突胶质细胞图谱，揭示髓鞘区域差异性；整合转录组和超微结构数据解析少突胶质细胞多样性形成机制。2026-2-18 测序技术 空间组学
CLIM-TIME将遗传性癌症驱动因素与免疫景观联系起来Cell开发了空间解析的体内CRISPR筛选平台CLIM-TIME，首次揭示肿瘤抑制基因丢失与转移性免疫结构及免疫治疗响应差异的关联机制2026-3-5 基因编辑 空间组学
空间转录组学以高分辨率绘制宿主-肠道微生物群生物地理图Nature Microbiology通过改进的Bulk polyadenylation技术增强微生物RNA捕获效率，并结合商业空间转录组平台，首次实现宿主-微生物互作的高分辨率空间可视化。2026-3-6 空间组学
拟南芥富含亮氨酸重复序列受体激酶复合物的质膜纳米尺度动态bioRxiv首次揭示植物受体激酶复合物在质膜纳米尺度的动态组织规律，发现配体结合受体与共受体通过纳米域相互作用实现信号传递，提出配体诱导的受体复合物形成是基于纳米尺度空间定位的确定性过程。2026-3-6 空间组学 蛋白质组学
DeepSRFusion：一种用于超分辨率粒子融合的点云深度学习框架bioRxiv创新点包括：1）提出自监督预训练框架，结合高斯混合模型表示单分子点云；2）两阶段优化策略与动态模板更新提升鲁棒性；3）引入聚类误差度量评估融合质量；4）在稀疏标记、大角度旋转等挑战条件下实现纳米级（~1.6nm）分辨率，较现有方法加速100倍以上。2026-3-1 空间组学
尿调节素促进免疫区隔并抑制替代性炎性小体介导的免疫至集合管炎症信号激活在早期急性肾损伤中的作用bioRxiv创新性整合转录组与空间蛋白成像技术揭示急性肾损伤早期分子机制，发现尿调节素通过空间区隔免疫细胞、抑制Nlrc4依赖的替代性炎性小体通路，调控肾小管-免疫细胞通讯，为急性肾损伤治疗提供新靶点。2026-3-1 测序技术 空间组学
衰老的时空蛋白质组景观：年龄敏感蛋白质组重构的结构决定因素bioRxiv创新性构建酵母衰老单细胞分析平台，首次实现跨物种蛋白质组空间重编程的定量解析，揭示蛋白质结构特征与衰老进程的生物物理关联规律。2026-3-1 蛋白质组学 空间组学 单细胞测序
ChatSpatial：基于模式约束的智能代理编排，实现可重复和跨平台的空间转录组学bioRxiv创新点包括：1) 通过LLM选择预验证工具模式而非生成自由代码，确保分析可重复性；2) 基于Model Context Protocol整合60+方法跨越Python/R生态；3) 实现跨平台验证与多步骤分析的确定性复现；4) 支持跨方法框架的探索性分析验证。2026-3-1 空间组学
神经内分泌肿瘤中肌成纤维细胞和补体分泌型癌相关成纤维细胞的空间组织bioRxiv首次通过近单细胞空间转录组学结合细胞分割技术，揭示神经内分泌肿瘤中跨解剖部位共享的10种间质转录状态，发现肌成纤维细胞与补体分泌型成纤维细胞在肿瘤微环境中存在空间分隔现象，并阐明其与胶原密度和肿瘤界面的关联。2026-3-1 空间组学 单细胞测序
