利用空间信息指导的RNA速度与veloAgent解析和调控细胞动力学bioRxiv创新点包括：1) 首次将空间信息整合到RNA velocity框架中，提升动态推断准确性；2) 开发亚线性内存扩展算法，实现大规模空间数据高效分析；3) 引入虚拟扰动模块，可模拟调控干预对细胞命运的影响。2026-1-9 单细胞测序 空间组学
OKR-Cell：开放世界知识辅助的单细胞基础模型与鲁棒跨模态细胞-语言预训练bioRxiv创新点包括：1) 利用大语言模型结合检索增强生成技术，通过开放世界知识丰富细胞文本描述；2) 设计跨模态鲁棒对齐目标，结合样本可靠性评估、课程学习和耦合动量对比学习，提升模型对噪声数据的鲁棒性。2026-1-9 单细胞测序 测序技术
RNA聚合酶III亚基Polr3a在颅面软骨和骨骼发育中的作用bioRxiv首次揭示Polr3a突变导致颅面发育缺陷的分子机制，发现tRNA转录减少和核糖体生物合成下降是关键因素，通过单细胞测序发现tp53上调但抑制无效，表明存在其他调控因子。2026-1-9 单细胞测序 核酸蛋白工具酶
利用最优运输预测单细胞对新型遗传扰动的响应bioRxiv提出基于最优运输理论的新型预测方法，通过注意力机制整合多源基因先验知识，无需依赖控制-扰动细胞配对即可对齐预测与观测数据，突破现有模型仅能处理已知扰动的局限性。2026-1-8 单细胞测序 测序技术
通过多模态分析揭示人新皮层谷氨酸能神经元bioRxiv创新性地整合形态学、电生理学和单细胞转录组数据，结合空间转录组技术，系统解析人新皮层谷氨酸能神经元的异质性，并揭示其与物种进化相关的形态电生理特征差异。2026-1-8 单细胞测序 空间组学
线粒体DNA突变的正向生殖系选择：卵母细胞的证据bioRxiv创新性提出卵母细胞中编码突变实际受正向选择而非纯化选择，通过新指标（细胞内克隆选择+中性同义突变参考）重新分析数据，发现不同基因（如Co1）存在纯化选择，揭示正向选择与纯化选择并存的复杂机制。2026-1-9 单细胞测序 蛋白质进化
Stack：单细胞生物学的上下文学习bioRxiv提出Stack基础模型，通过表格注意力机制利用细胞上下文信息生成表征，在零样本场景下显著优于传统方法；实现无需数据微调的上下文学习，可预测任意条件对细胞群体的影响；构建覆盖28种组织、201种扰动的全基因组扰动细胞图谱Perturb Sapiens。2026-1-9 单细胞测序
Stack：单细胞生物学的上下文学习bioRxiv提出Stack基础模型，通过表格注意力机制利用细胞上下文信息生成表征，在零样本场景下显著优于传统方法；实现无需数据微调的上下文学习，可预测任意条件对细胞群体的影响；构建覆盖28种组织、201种扰动的全基因组扰动细胞图谱Perturb Sapiens。2026-1-9 单细胞测序
人类大脑中不同的神经元群体结合内容和上下文Nature通过单神经元记录技术发现人类大脑中存在分离的内容神经元和上下文神经元，其协调活动能够灵活地将记忆内容置于特定上下文中，揭示了记忆编码的神经机制创新。2026-1-7 单细胞测序
双向CRISPR筛选解析依赖GLIS3的纤维化细胞回路Nature整合单细胞与空间组学数据并结合双向CRISPR筛选技术，首次发现转录因子GLIS3是溃疡性结肠炎慢性炎症和纤维化的核心驱动因子，并揭示其作为疾病严重程度生物标志物的潜力。2026-1-7 单细胞测序 空间组学 基因编辑
同时检测AAV基因组及其转录本的原位单细胞水平方法 [METHOD]RNA Journal开发了基于padlock探针的滚环扩增技术，无需mRNA→cDNA转换即可同时检测AAV单链DNA（+/-）和mRNA；通过引入内含子区分DNA/mRNA，结合酶切技术区分单/双链DNA，实现AAV基因组加工过程的动态追踪。2025-12-16 测序技术 单细胞测序 空间组学 核酸蛋白工具酶
