整合单细胞和空间转录组学分析揭示骨肉瘤在不同部位和物种间的保守和独特生态系统bioRxiv1. 构建跨物种单细胞转录组学数据集（涵盖人、犬、PDX和小鼠模型）；2. 发现6种保守的肿瘤细胞转录状态及物种/部位特异性肿瘤相关细胞重编程；3. 通过空间转录组学验证肿瘤微环境空间结构；4. 揭示犬类骨肉瘤作为人类疾病更忠实模型的生物学依据；5. 发现转移性肺病变中纤维连接蛋白驱动的促转移纤维化生态位机制。2026-1-14 单细胞测序 空间组学
来源于微生物群的代谢物塑造慢性HIV-1感染中CD4⁺ T细胞分化和免疫衰老bioRxiv首次发现肠道微生物代谢物（GDBMs）通过细胞关联浓度而非系统性水平调控CD4+ T细胞代谢与功能状态；揭示p-cresol sulfate（PCS）诱导T细胞周期停滞、线粒体功能障碍及衰老相关程序的分子机制；建立微生物代谢物与HIV-1病毒库大小的免疫代谢关联轴。2026-1-14 单细胞测序 蛋白质组学
Hypatia：一种用于跨细胞群体分析异构体的定量方法集bioRxiv开发了基于Tsallis熵和Cramer V的系统性方法，首次实现跨细胞群体异构体变异的稳健比较分析，并在胶质母细胞瘤、肾细胞癌和心脏组织中验证了其临床相关性。2026-1-14 单细胞测序 测序技术
基于高通量长读长单细胞转录组的单细胞融合基因发现bioRxiv开发LongFUSE工具，通过XOR逻辑运算和严格过滤标准，实现单细胞水平融合基因及其剪接异构体的高精度检测，显著优于现有方法。2026-1-14 单细胞测序 测序技术
靶向衰老下丘脑神经免疫轴的药理干预可预防与年龄相关的生理衰退bioRxiv首次揭示下丘脑通过神经免疫机制驱动系统性衰老，发现CD8 T细胞浸润与胶质细胞相互作用导致神经炎症，鉴定CCL3/4-CCR5轴为关键治疗靶点，并证明其阻断剂可逆转衰老相关生理衰退。2026-1-12 单细胞测序
Sox8和Sox9调控视网膜米勒胶质细胞的分化和核定位bioRxiv首次揭示Sox8/9通过抑制早期视网膜祖细胞命运决定和促进光感受器生成参与时间性身份编程，同时发现其在成熟米勒胶质细胞中维持核层定位和成熟状态的关键作用，而非直接调控胶质生成或神经发生能力抑制。2026-1-13 单细胞测序 基因编辑
通过测量细菌杀伤来预测抗生素治疗结果Nature Microbiology该研究利用单细胞测序技术分析抗生素诱导的细菌细胞死亡动态，建立了预测抗结核药物治疗效果的新型生物标志物体系，为精准抗感染治疗提供潜在指导方案。2026-1-12 单细胞测序
自然语言中的单细胞探索Nature Methods创新性地将自然语言处理技术与单细胞数据分析结合，开发了基于语言模型的单细胞数据探索方法，可能提升细胞异质性解析的效率和深度。2026-1-12 单细胞测序
通过ISSAAC-seq进行单核染色质可及性与基因表达联合分析Nature Protocols创新性地开发了ISSAAC-seq技术，首次实现单核水平上染色质可及性与基因表达的同步检测，兼容板式和液滴两种单细胞分离平台，突破了传统方法在通量和分辨率上的限制。2026-1-12 测序技术 单细胞测序
物种特异性iNOS表达区分结核病中上皮细胞和髓系细胞的IFNγ反应bioRxiv发现人类和非人灵长类髓系细胞中NOS2表达极低，而人类呼吸道上皮细胞持续高表达NOS2；iNOS蛋白定位在上皮细胞而非巨噬细胞，颠覆了传统以小鼠巨噬细胞为中心的结核免疫模型，揭示上皮细胞是人类结核病中iNOS的主要来源。2026-1-12 单细胞测序 空间组学
复制应激增加疟疾寄生虫基因组中的新生拷贝数变异NAR创新性揭示了复制应激与DNA修复机制在疟原虫基因组新生拷贝数变异（CNVs）生成中的关键作用，通过低输入基因组学技术结合计算工具，发现抗疟药物处理显著提升CNVs发生率，并发现这些变异涉及人类感染相关基因通路。2026-1-9 测序技术 单细胞测序
多克隆和单克隆患者来源的食管Barrett上皮和食管腺癌类器官模型建立疾病进展和治疗反应异质性分析平台bioRxiv创新性构建涵盖正常食管组织、Barrett食管和食管腺癌的116个患者来源类器官库，开发单细胞克隆培养技术揭示肿瘤异质性，发现Barrett食管调控成纤维细胞表型的作用，并系统解析食管腺癌对多种治疗方式的响应差异。2026-1-9 测序技术 单细胞测序
