生态过滤在海洋海绵微生物组组装中的预测作用优于协同进化bioRxiv1) 通过大规模基因组数据和16S rRNA测序技术揭示生态过滤对微生物组结构的主导作用;2) 发现宿主生理特征(HMA-LMA表型)比宿主系统发育更有效预测微生物组成;3) 证明海绵-微生物关联应视为生态共生体而非协同进化单元。2026-2-9 测序技术
DEPower:基于DESeq2的近似功效分析bioRxiv创新性地将DESeq2统计框架与功效分析结合,开发了首个针对单细胞和bulk RNA-seq实验的样本量计算工具,突破传统模拟方法的局限性,并通过网页工具实现普及化应用。2026-2-9 测序技术 单细胞测序
肠道上皮Casd1影响粘液唾液酸O-乙酰化及对大肠粘膜损伤的易感性bioRxiv首次揭示Casd1是粘液O-乙酰化的唯一调控因子,发现OAc-Sia修饰在基线状态下对粘膜屏障功能非必需,但在炎症损伤中具有防御作用,且通过多组学技术(病毒探针成像、HPLC-MS糖组学、16S rRNA测序)系统验证了宿主-微生物互作机制。2026-2-9 测序技术 基因编辑
通过宏基因组挖掘和机器学习揭示Cas9 PAM多样性Nature Communications创新性地结合宏基因组数据挖掘与机器学习算法,系统解析了数千种Cas9酶的PAM序列特异性,显著拓展了CRISPR-Cas9基因编辑技术的靶向范围。2026-2-8 基因编辑 核酸蛋白工具酶 测序技术
利用基于序列上下文的Transformer模型DeepOmicsFFPE-PLUS从福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPE)衍生的全外显子组测序(WES)和全基因组测序(WGS)中准确检测体细胞变异bioRxiv开发基于Transformer架构的AI工具DeepOmicsFFPE-PLUS,通过学习序列上下文特征有效区分FFPE样本中的真实体细胞变异与固定诱导的伪影;首次实现低频变异的高灵敏度检测,并恢复被FFPE伪影掩盖的微卫星不稳定性(MSI)等生物学特征。2026-2-7 测序技术
高架温室与露天农业系统中土壤微生物群落的比较分析bioRxiv创新性整合扩增子测序、土壤养分数据、AMF孢子计数和共现网络分析,揭示高架温室土壤微生物群落结构变化规律,发现高营养环境下AMF功能抑制机制及微生物网络模块化特征。2026-2-7 测序技术
光敏剂邻近标记技术捕获脂质和蛋白质互作组Nature Chemical Biology开发了一种基于光敏剂的邻近标记平台POCA,通过单线态氧介导的蛋白质捕获技术,首次实现了活细胞中脂质和蛋白质互作组的系统性分析。2026-2-6 蛋白质组学 测序技术
双蛤物种63K单核苷酸多态性芯片用于可持续生产与野生资源保护bioRxiv创新性开发了首个针对 Manila clam(Ruditapes philippinarum)和 grooved carpet shell(R. decussatus)的63K SNP芯片,通过染色体级别基因组组装和全基因组重测序策略,实现了跨物种高通量基因分型,验证了芯片在种群遗传学和育种中的应用价值。2026-2-6 测序技术
SUMOylation缺失导致PRC1异常聚集和三维基因组重构独立于H3K27me3bioRxiv发现SUMOylation调控PRC1冷凝体形成,揭示其通过改变三维基因组架构影响基因表达的机制,且该过程独立于H3K27me3组蛋白修饰2026-2-6 测序技术 蛋白质组学
一种可扩展、与图谱对齐且可解析克隆型的单细胞转录组学模块化转录富集策略bioRxiv创新点包括:1) TRTL方法通过模块化设计实现从几十到数千基因的灵活扩展;2) 保留逆转录步骤可捕获高变转录本(如TCR/BCR);3) 结合组合索引RNA测序实现低深度下精准细胞注释;4) 开发targeted-sci-Plex协议同步解析T细胞命运轨迹和克隆型。2026-2-6 测序技术 单细胞测序
每细胞都重要:单细胞分辨率揭示番茄根对氮的响应bioRxiv首次通过单细胞多组学分析揭示番茄根部细胞类型特异性氮响应机制,构建了氮条件下的基因调控网络,为提高园艺作物氮利用效率提供基因资源。2026-2-7 单细胞测序 测序技术