利用m5C-Rol-LAMP检测大肠杆菌中应激依赖性m5C rRNA动态变化RNA Journal开发了基于qPCR的m5C-Rol-LAMP方法,首次发现细菌rRNA修饰水平具有应激依赖性和位点特异性可逆变化,实现了RNA修饰的定量检测。2026-1-16 测序技术 核酸蛋白工具酶
5' UTR顺式调控逻辑调控经典和非编码RNA上的核糖体结合RNA Journal1. 系统解析5' UTR结构对mRNA与ncRNA翻译效率的差异化调控机制;2. 开发基于机器学习的plusCE模型,显著提升翻译效率预测精度;3. 揭示核糖体结合ncRNA的非编码进化特征,修正对ncRNA翻译潜力的误判。2026-1-16 测序技术 蛋白质组学
MUTACLASH:利用交联诱导的突变识别功能性小RNA靶点[报告]RNA Journal开发MUTACLASH工具系统分析CLASH数据集中的交联诱导突变(CIMs),发现CIMs可作为Argonaute蛋白结合的分子足迹,尤其在非典型miRNA/piRNA结合位点和低杂交丰度靶点中表现出更强的调控效应,为识别被现有工具忽略的功能性小RNA靶点提供新方法。2026-1-16 测序技术 核酸蛋白工具酶
通过带帽小RNA测序(csRNA-seq)从总RNA中分析活性RNA聚合酶II转录起始位点Nature Protocols创新性地提出利用总RNA而非纯化RNA进行高分辨率全基因组RNA聚合酶II转录起始位点分析,可同时检测稳定RNA和瞬时表达RNA,适用于多种样本类型。2026-1-16 测序技术
NF-κB通过染色质调控在果蝇中抑制营养依赖的转录程序NAR发现NF-κB(Relish)通过调节组蛋白乙酰化限制染色质可及性,从而抑制代谢基因转录;揭示HDAC6与NF-κB/Relish在代谢基因调控区的相互作用,阐明先天免疫因子通过表观遗传机制调控代谢适应的新机制。2026-1-15 测序技术
DNA复制终止通过多种机制引发基因组不稳定性NAR创新性揭示了DNA复制终止与基因组不稳定的多机制联系,发现Tus–ter系统与R环代谢的关联,以及RecG解旋酶和3′外切酶在调控复制终止中的关键作用,为抗菌药物开发提供新靶点。2026-1-16 测序技术 核酸蛋白工具酶
细胞周期中染色质占据动态的全面分析NAR首次系统揭示细胞周期进程中染色质动态变化与转录调控的复杂关系,发现染色质重构存在转录依赖性和非依赖性双重机制,并开发基于染色质特征的高斯过程模型预测转录动态2026-1-16 测序技术 核酸蛋白工具酶
IL-4Rα和IL-13Rα1在实验性嗜酸性胃炎中免疫细胞浸润和上皮重塑中的不同作用bioRxiv1. 建立实验性EoG模型揭示了IL-4Rα和IL-13Rα1在免疫细胞浸润与上皮重塑中的特异性作用机制;2. 通过RNA测序发现EoG与EoE存在组织特异性转录组差异;3. 阐明IL-4Rα信号通路在炎症细胞招募中的核心作用,而IL-13Rα1更侧重于上皮重塑调控。2026-1-15 测序技术 基因编辑
表征铜背猴(Plecturocebus cupreus)新生生殖细胞突变的速率和模式bioRxiv首次为铜背猴构建群体规模基因组资源,通过15个亲代-子代三元组的深度全基因组测序和泛基因组图计算方法,揭示了非人灵长类中最强的父系年龄相关突变偏倚,并量化了性染色体与常染色体的突变率差异。2026-1-15 测序技术
加拿大新斯科舍省新型Labyrinthulomycetes的系统发育与形态学bioRxiv首次从加拿大新斯科舍省分离获得17种新型Labyrinthulomycetes菌株,结合18S rDNA测序和显微镜形态分析,发现三个新属(Thraustochytrium、Ulkenia、Oblongichytrium),扩展了大西洋加拿大水域Labyrinthulomycetes的遗传多样性,为Ulkenia和Oblongichytrium这两个基因组资源匮乏的属提供了新研究材料。2026-1-15 测序技术
从整体肿瘤测序中重建克隆解析的转录程序bioRxiv提出PICTographPlus框架,首次整合DNA推断的克隆系统发育树与整体RNA-seq数据,通过系统发育树正则化混合模型实现克隆特异性基因表达推断,揭示肿瘤进化过程中关键通路的获得与丢失事件。2026-1-15 测序技术 单细胞测序
扁桃体类器官模型揭示了初次感染期间Epstein-Barr病毒侵染生发中心B细胞的状态bioRxiv开发了EBV人类扁桃体类器官模型,揭示EBV感染促进B细胞向生发中心样表型分化,发现EBV感染细胞独特的转录程序,以及CD4 T细胞对EBV阳性B细胞增殖的抑制作用。2026-1-15 测序技术