衰老将小胶质细胞再填充转化为适应不良的重编程,加剧认知缺陷bioRxiv首次揭示衰老导致小胶质细胞再填充后出现异常基因表达模式(包括微胶质身份基因表达降低、免疫相关基因重编程和神经元基因去抑制),并发现该过程特异性损害老年小鼠的视觉辨别学习和注意力转换能力,为衰老相关认知障碍的治疗策略提供新视角2026-1-9 测序技术
环境DNA宏条形码技术在北极峡湾食物网高分辨率重建中的应用bioRxiv创新性采用eDNA宏条形码技术结合两种采样配置(鱼笼关联采样与拖网断面采样),通过同时分析线粒体COI基因(后生动物)和核糖体18S基因(原生生物),首次实现北极峡湾沿海与近海两个生态域的食物网结构差异量化,并建立基于四个食物网指标(物种丰富度、连接数、直接连接度、通用性)的生态网络分析框架。2026-1-9 测序技术
运动性和非运动性李斯特菌物种在土壤中通过不同的基因组和生态策略实现广泛的地理分布bioRxiv首次揭示运动性细菌(L. welshimeri)通过增强运动性和宿主殖民能力实现长距离传播,而非运动性细菌(L. booriae)依赖基因组可塑性和代谢多样性适应局部环境,为理解微生物地理分布机制提供新视角。2026-1-9 测序技术
大西洋热液喷口虾类的高基因流动及生态型谱系的多次脊殖民化与不同共生关系bioRxiv创新性揭示了深海热液喷口虾类跨洋中脊的高基因流动现象,发现不同生态型谱系间存在显著遗传相似性,提出共生关系驱动种群快速扩张的假说,并重新定义了物种分类体系以反映形态可塑性与共生适应性关系。2026-1-9 测序技术
鸟类羽虱(Phthiraptera: Ischnocera)的系统基因组框架bioRxiv基于260个羽虱样本和25个外群的基因组数据,利用2395个核基因通过拼接和共祖方法构建高支持度的系统发育树,解决了形态学收敛导致的进化关系研究难题,并为未来比较研究提供框架。2026-1-9 测序技术
GraphESMStable:融合预训练序列模型与图神经网络的蛋白质稳定性预测深度学习框架bioRxiv创新性提出结合预训练蛋白质序列语言模型与图神经网络的跨模态融合框架,引入残差级交叉注意力机制实现多模态表征深度整合,开发可预测单点突变全景图的专用预测头和建模多点突变非加性效应的Epistasis Decoder模块。2026-1-9 蛋白质组学 蛋白质进化
利用空间信息指导的RNA速度与veloAgent解析和调控细胞动力学bioRxiv创新点包括:1) 首次将空间信息整合到RNA velocity框架中,提升动态推断准确性;2) 开发亚线性内存扩展算法,实现大规模空间数据高效分析;3) 引入虚拟扰动模块,可模拟调控干预对细胞命运的影响。2026-1-9 单细胞测序 空间组学
OKR-Cell:开放世界知识辅助的单细胞基础模型与鲁棒跨模态细胞-语言预训练bioRxiv创新点包括:1) 利用大语言模型结合检索增强生成技术,通过开放世界知识丰富细胞文本描述;2) 设计跨模态鲁棒对齐目标,结合样本可靠性评估、课程学习和耦合动量对比学习,提升模型对噪声数据的鲁棒性。2026-1-9 单细胞测序 测序技术
22q11.2微缺失位点中单倍体不足的线粒体基因之间的抑制性遗传相互作用定义了脑和心脏表型bioRxiv创新性揭示了MRPL40和SLC25A1基因的单倍体不足效应及其遗传互作机制,发现杂合突变小鼠的表型抑制现象,阐明了线粒体基因剂量失衡对组织发育和生理功能的调控网络。2026-1-9 蛋白质组学 基因编辑
RNA聚合酶III亚基Polr3a在颅面软骨和骨骼发育中的作用bioRxiv首次揭示Polr3a突变导致颅面发育缺陷的分子机制,发现tRNA转录减少和核糖体生物合成下降是关键因素,通过单细胞测序发现tp53上调但抑制无效,表明存在其他调控因子。2026-1-9 单细胞测序 核酸蛋白工具酶
利用最优运输预测单细胞对新型遗传扰动的响应bioRxiv提出基于最优运输理论的新型预测方法,通过注意力机制整合多源基因先验知识,无需依赖控制-扰动细胞配对即可对齐预测与观测数据,突破现有模型仅能处理已知扰动的局限性。2026-1-8 单细胞测序 测序技术
THC暴露在人类前额叶皮层发育中的双重转录组和表观基因组特征bioRxiv创新性整合多组学技术(bulk RNA-seq/WGBS/电生理学)揭示THC暴露导致的神经发育异常机制,首次发现THC暴露与ASD风险基因网络的显著关联,并通过人类PFCOs模型揭示表观遗传调控与转录激活的动态失衡。2026-1-8 测序技术