通过多模态分析揭示人新皮层谷氨酸能神经元bioRxiv创新性地整合形态学、电生理学和单细胞转录组数据,结合空间转录组技术,系统解析人新皮层谷氨酸能神经元的异质性,并揭示其与物种进化相关的形态电生理特征差异。2026-1-8 单细胞测序 空间组学
线粒体DNA突变的正向生殖系选择:卵母细胞的证据bioRxiv创新性提出卵母细胞中编码突变实际受正向选择而非纯化选择,通过新指标(细胞内克隆选择+中性同义突变参考)重新分析数据,发现不同基因(如Co1)存在纯化选择,揭示正向选择与纯化选择并存的复杂机制。2026-1-9 单细胞测序 蛋白质进化
野生倭黑猩猩的靶向染色体测序在洛马米河以东识别出一个遗传上独特的亚种群bioRxiv创新性地利用非侵入性粪便样本进行染色体靶向测序,发现洛马米河作为基因流动屏障导致的三个亚种群分化;通过遗传框架实现样本地理定位(精度达50公里),揭示河流对种群隔离的作用机制。2026-1-9 测序技术
Stack:单细胞生物学的上下文学习bioRxiv提出Stack基础模型,通过表格注意力机制利用细胞上下文信息生成表征,在零样本场景下显著优于传统方法;实现无需数据微调的上下文学习,可预测任意条件对细胞群体的影响;构建覆盖28种组织、201种扰动的全基因组扰动细胞图谱Perturb Sapiens。2026-1-9 单细胞测序
Stack:单细胞生物学的上下文学习bioRxiv提出Stack基础模型,通过表格注意力机制利用细胞上下文信息生成表征,在零样本场景下显著优于传统方法;实现无需数据微调的上下文学习,可预测任意条件对细胞群体的影响;构建覆盖28种组织、201种扰动的全基因组扰动细胞图谱Perturb Sapiens。2026-1-9 单细胞测序
细胞周期抑制保持小鼠胃肠样体的稳健发育但重新平衡谱系bioRxiv创新性地发现哺乳动物发育中核心分化程序在细胞周期抑制下仍能稳健进行,同时揭示细胞周期动态通过调节谱系分化时机和效率影响发育平衡,突破传统对细胞周期与发育关系的认知。2026-1-8 单细胞测序
解锁纳米级样本超灵敏磷酸化蛋白质组学:基于Ti-PAN尖端的快速IMAC富集平台bioRxiv开发了基于高亲水性PAN纤维的Ti-PAN富集尖端,实现8分钟快速原位IMAC富集,显著降低样品损耗并提升灵敏度;结合DDM裂解与turboDDA技术,首次在5个卵母细胞样本中鉴定出2709个磷酸化位点,揭示了卵母细胞成熟相关关键激酶;该方法具备高通量自动化潜力,为微量样本磷酸化组学研究提供新范式。2026-1-8 蛋白质组学
resolveS:一种超快速、内存高效且无需参考的RNA测序链特异性检测工具bioRxiv创新点包括:1) 无需依赖参考基因组,通过核糖体RNA进化保守性结合统计框架实现链特异性检测;2) 处理速度极快(<10秒/样本),内存占用极低(<0.5GB);3) 提供Singularity/Apptainer镜像和便携式可执行版本,提升可重复性和流程集成性。2026-1-8 测序技术
基于深度学习的碎片离子选择方法提升基于质谱的蛋白质组学定量分析bioRxiv创新点包括:1) 提出QuantSelect算法,通过自监督深度学习整合碎片离子相关性、保留时间等多维特征;2) 采用正则化加权方差损失函数,无需真实标签即可训练模型;3) 在alphaDIA流程中集成该方法,使定量准确率提升68%(混合物种数据)和18%(单细胞数据)。2026-1-8 蛋白质组学 单细胞测序
基于短读长时间序列基因组数据的连锁感知适应度推断bioRxiv提出一种计算高效的方法,通过短读长测序数据推断适应度时考虑遗传连锁效应,解决了传统方法因无法获取完整等位基因对频率信息而无法解析连锁干扰的问题,并在HIV和SARS-CoV-2真实数据中验证了方法的实用性。2026-1-8 测序技术
利用纳米孔以单氨基酸分辨率识别全长蛋白质的单分子技术bioRxiv创新性地结合解折叠酶与增强电渗流纳米孔技术,实现单次纳米孔通过过程中蛋白质的连续识别,可检测单氨基酸替换引起的电荷/尺寸差异,为单分子蛋白质测序和高通量蛋白质组学提供新方法。2026-1-8 测序技术 蛋白质组学
MYST乙酰转移酶是SETBP1突变白血病中可靶向的治疗脆弱性bioRxiv1. 首次发现MYST乙酰转移酶是SETBP1突变白血病的潜在治疗靶点;2. 揭示SETBP1突变通过增强MYST复合物在Hoxa基因簇的定位来调控基因表达的新机制;3. 临床级MYST抑制剂PF-9363在小鼠模型和PDX模型中均显示显著疗效。2026-1-8 蛋白质组学 核酸蛋白工具酶