单一微小RNA靶点的去抑制导致小鼠雌性不孕NAR发现miR-200a/b-ZEB1双重负反馈环路通过调控垂体基因表达(包括miR-200a/b自身及间质/神经元基因)导致雌性不孕,揭示单个转录因子的miRNA调控可广泛影响基因表达并产生显著表型2026-1-14 基因编辑
光遗传学BlueGENEs工程化至人类安全港位点NAR开发了优化的光遗传基因开关BlueGENEs,实现稳定高效的细胞系生成;利用设计性核酸内切酶和噬菌体整合酶克服随机基因递送问题;应用于凋亡调控、3D组织构建及与生物打印技术整合的体外模型系统。2026-1-14 基因编辑 合成生物学 核酸蛋白工具酶
基于空间模式增强图卷积神经网络的三维空间转录组重建bioRxiv创新点包括:(I)通过三维重建提升空间域识别精度,(II)揭示三维细胞组织中的细胞间通讯景观,(III)建立三维器官发育时序空间模式,(IV)注释二维坐标无法捕捉的三维空间轨迹。2026-1-14 空间组学
单细胞转录组学中的异常检测揭示疾病富集的细胞毒性免疫群体bioRxiv提出基于异常检测的框架补充传统聚类方法,发现疾病相关罕见免疫群体;验证异常细胞具有更优质量指标;通过Isolation Forest算法和子聚类分析揭示异常细胞的异质性功能状态。2026-1-14 单细胞测序
临床组织中HER2的纳米尺度分级bioRxiv开发了基于单分子定位显微镜(SMLM)的定量工作流程,实现了HER2纳米聚类的可视化;通过纳米尺度聚类分析重新分类样本,为HER2低表达患者的靶向治疗分层提供新方法。2026-1-14 蛋白质组学
整合单细胞和空间转录组学分析揭示骨肉瘤在不同部位和物种间的保守和独特生态系统bioRxiv1. 构建跨物种单细胞转录组学数据集(涵盖人、犬、PDX和小鼠模型);2. 发现6种保守的肿瘤细胞转录状态及物种/部位特异性肿瘤相关细胞重编程;3. 通过空间转录组学验证肿瘤微环境空间结构;4. 揭示犬类骨肉瘤作为人类疾病更忠实模型的生物学依据;5. 发现转移性肺病变中纤维连接蛋白驱动的促转移纤维化生态位机制。2026-1-14 单细胞测序 空间组学
α5胆碱能烟碱受体亚基突变小鼠中与共情相关行为的改变bioRxiv创新性构建了两种突变小鼠模型(5KI和5KO),揭示了5*nAChRs在情绪识别和亲社会行为中的关键作用,发现性别依赖的行为模式,并为AUD提供了潜在的临床前模型。2026-1-14 基因编辑
工程化变构调控增强基于CRISPR-CasX的表观遗传抑制剂的特异性和效力bioRxiv创新点包括:1) 设计了整合DNMT3A变构调控的ELXRs系统,通过H3K4me0依赖的激活机制显著降低脱靶效应;2) 在CasX框架中实现比Cas9更高的编辑特异性;3) 建立了依赖转录抑制结构域的多步骤调控机制;4) 体内实验显示可实现精准的PCSK9沉默且无明显脱靶效应。2026-1-14 基因编辑 合成生物学 核酸蛋白工具酶
协同的植物-微生物互作驱动人工湿地中试系统中环烷酸馏分化合物的修复bioRxiv首次通过宏转录组学揭示芦苇根际微生物群落与植物基因表达的协同响应机制,发现Burkholderiales和Rhizobiales的氧化还原酶在NAFC降解中的关键作用,并证实植物通过上调氧化还原酶和转运蛋白基因参与毒性物质清除。2026-1-14 测序技术
生命周期复杂性影响迁徙和留宿宿主间的寄生虫共享bioRxiv创新性地利用单一宿主物种(银眼鸟)的迁徙亚种与留宿亚种对比,结合分子技术揭示寄生虫生命周期复杂性对传播模式的影响机制;首次通过宏条形码和高通量测序系统解析多寄生虫共存格局,并提出迁徙行为与寄生虫传播潜力的关联模型。2026-1-14 测序技术
推断铜色吼猴(Plecturocebus cupreus)的精细尺度突变和重组率bioRxiv首次在铜色吼猴中绘制突变和重组率的精细地图,结合高质量基因组数据揭示其遗传变异机制,并为该物种的进化模型构建提供关键参数。2026-1-14 测序技术
通过纳米孔测序与错误感知UMI映射进行定量全长转录组分析bioRxiv开发了UMImap工具,通过整合转录本感知的UMI校正与长读长异构体组装,解决了纳米孔测序中PCR扩增偏差和高错误率下UMI识别难题,实现了全长转录本的高精度定量分析,并发现了大量新型长异构体。2026-1-14 测序技术