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#蛋白质组学

Pichia-CLM:基于语言模型的Komagataella phaffii密码子优化流程

PNAS
提出基于深度学习语言模型的密码子优化方法,通过优化密码子使用提升Komagataella phaffii中重组蛋白产量,突破传统优化方法的局限性。
2026-2-17
合成生物学
蛋白质组学

数百种脂质的蛋白质载体已被鉴定

Nature
通过生化方法系统鉴定人类脂质转移蛋白与脂质的相互作用,揭示了脂质运输的分子机制和蛋白质载体的功能特征。
2026-2-25
蛋白质组学

深度学习框架ChIANet在不同功能背景下预测蛋白质介导的染色质结构

bioRxiv
提出多模态深度学习框架ChIANet,首次实现仅依赖蛋白质结合图谱预测染色质接触图和环结构;整合Transformer长距离建模与多任务学习,首次揭示不同蛋白质(CTCF/Cohesin/RNAPII)介导的染色质结构在保守性与可塑性上的差异;首次发现RNAPII介导的染色质环与癌症中ecDNA的强关联。
2026-2-25
蛋白质组学
空间组学

鉴定连接DNA损伤应答过程的FANCD2相互作用蛋白基序(DIP-box)

bioRxiv
首次发现FANCD2的保守酸性区域通过DIP-box基序直接招募多种DNA修复相关蛋白(包括组蛋白修饰和RNA加工因子),并利用冷冻电镜、AlphaFold和生化重构技术揭示其作为DNA修复蛋白互作枢纽的结构基础。
2026-2-25
蛋白质组学
蛋白质进化

电解氢水通过前馈环路机制在体外肠道细胞中的功能作用的综合分析

bioRxiv
创新性地揭示电解氢水通过前馈环路调控肠道细胞氧化应激和紧密连接形成的分子机制,构建了包含miRNA-ceRNA网络和TF-miRNA基因网络的双重调控模型,并发现其通过稳定CUL5和GOLGA7促进细胞分化的新型作用路径。
2026-2-25
测序技术
蛋白质组学

肿瘤源性和交叉呈递肽抗原的分析定义了改进的免疫治疗策略

bioRxiv
通过免疫肽组学分析鉴定超过1000个胶质母细胞瘤交叉呈递抗原,发现其特征由抗原呈递细胞内在加工途径塑造,并证实编码这些抗原的mRNA疫苗可显著延迟肿瘤生长并激活特异性T细胞应答。
2026-2-25
蛋白质组学

Alport综合征变异体揭示胶原蛋白IV α565-α121支架在鲍曼氏囊中的生物活性

bioRxiv
发现COL4A5的Z-appendage变异导致鲍曼氏囊结构异常而非肾小球基底膜损伤,通过结构建模揭示α565-α121支架异常二级结构可能影响组织功能,为Alport综合征病理机制提供新视角。
2026-2-25
基因编辑
蛋白质组学

镍依赖磺酰胺合成酶的结构-功能及机制分析

Nature Catalysis
首次解析磺酰胺合成酶SbzM的三维结构,阐明其镍离子依赖的催化机制,揭示了天然产物中磺酰胺基团的生物合成路径。
2026-2-23
蛋白质组学

硫醇盐类物质在氧化还原化学生物学中的多方面作用

Nature Chemical Biology
系统综述了蛋白质硫醇化/多硫醇化修饰的分子机制,提出了其在氧化还原调控中的新型作用模式,并展望了基于硫醇化修饰的靶向治疗策略创新
2026-2-23
蛋白质组学

一种睾丸特异性E3泛素连接酶复合物调控精子发生和男性生育能力

Nature Communications
发现睾丸特异性E3泛素连接酶复合物ECSASB9通过促进TUBB4A降解调控精子发生,揭示其在男性生育能力中的关键作用,并发现ASB9致病变异与人类不育的关联。
2026-2-24
蛋白质组学

可移动遗传因子在暗基因组中的研究

Nature Biotechnology
创新性提出通过技术突破解析暗基因组中转座子的致病机制,发现其作为新型治疗靶点的潜力,为疾病干预提供新方向。
2026-2-23
测序技术
蛋白质组学

染色质环蛋白质组学发现组蛋白去甲基化酶的非催化功能

Nature Genetics
开发了LoopID蛋白质组学方法,发现JMJD2去甲基酶通过内在无序结构域介导增强子-启动子环形成的新机制,揭示其非催化功能与凝聚体机制相关
2026-2-24
蛋白质组学
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一个普通的干饭人🍚
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Yanaka等人论文的更正:通过计算与实验方法探索人类免疫球蛋白G的糖型依赖性动态调控
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