早期灵长类动物胚胎着床期的高分辨率空间转录组和蛋白质组分析bioRxiv首次在早期灵长类原肠胚中实现高分辨率空间转录组与蛋白质组联合分析,构建了包含6类主要细胞群体的分子图谱,揭示了羊膜命运决定的WNT信号通路关键作用,并发现多个谱系亚型及调控网络。2026-2-11 空间组学 蛋白质组学
鞘磷脂合成酶-1的缺失不会导致秀丽隐杆线虫的卵滞留或运动缺陷bioRxiv通过构建多个sms-1基因敲除突变体,发现原始研究中观察到的产卵和运动缺陷可能由背景突变导致,推翻了sms-1缺失直接导致表型缺陷的结论,揭示了基因功能研究中背景遗传因素的重要性。2026-2-12 基因编辑
肺炎链球菌通过肺炎链球菌溶素依赖的方式调控甲型流感病毒的重配bioRxiv发现肺炎链球菌活菌通过肺炎链球菌溶素抑制流感病毒重配,而灭活菌体则促进重配;揭示鼻咽部微生物群通过细菌及其代谢产物对流感病毒进化动态的双向调节作用机制。2026-2-12 基因编辑 蛋白质组学
C9orf72重复扩增重塑ALS中的三维染色质景观bioRxiv发现C9orf72-STR扩增通过诱导神经元特异性染色质环形成,导致转录组失调;提出RNA-DNA相互作用驱动异常染色质环形成的机制;揭示核拓扑改变与基因失调在神经退行性疾病中的关联。2026-2-11 空间组学
埃塞俄比亚本土牛在干旱和湿热气候中热应激适应的基因组基础bioRxiv首次揭示埃塞俄比亚本土牛在极端气候下的基因组适应机制,发现干旱与湿热环境分别驱动氧化应激、线粒体功能及免疫代谢等不同通路的基因选择信号,同时识别出VEGFC等跨气候类型的共有热耐受基因,为培育抗热牲畜提供关键分子标记。2026-2-11 测序技术
一种利用高分辨率离子迁移率的并行累积-迁移率对齐碎裂策略用于高性能蛋白质组学分析bioRxiv创新点包括:1) 提出PAMAF模式利用SLIM技术的高分辨率离子迁移分离能力替代传统四极杆过滤;2) 通过迁移率基时间对齐实现更高特征识别效率;3) 达到99%离子保留和100%离子利用效率;4) 解决同位素/异构体分离难题;5) 与DDA相比低负载流程识别能力提升100倍。2026-2-11 蛋白质组学
DIA-CLIP:一种用于零样本DIA蛋白质组学的通用表示学习框架bioRxiv1. 提出跨模态表示学习框架,实现肽段序列与质谱信号的统一表征;2. 通过双编码器对比学习与编码器-解码器架构,无需运行特定训练即可完成高精度零样本PSM推断;3. 在单细胞和空间蛋白质组学中显著提升蛋白质鉴定率(+45%)并降低错误发现率(-17%)。2026-2-11 蛋白质组学 单细胞测序 空间组学
用于测量多重序列比对中多样性的谱框架bioRxiv提出可解释的Leff度量量化MSA有效信息,揭示进化约束对RNA和蛋白质序列多样性的影响,建立与结构预测准确性的关联,并用于评估实验库的创新性与冗余度。2026-2-11 蛋白质进化 蛋白质组学
SIPdb:一种用于通过反向生态学方法将扩增子序列与微生物活动联系起来的稳定同位素探针数据库和分析仪表板bioRxiv创新点包括:1) 构建标准化的SIP实验数据库和可视化分析平台;2) 整合三种主流SIP梯度分离策略和四种差异丰度分析方法;3) 提供跨研究的元分析能力,验证70.1%的已报道同位素整合菌群;4) 通过非SIP研究案例展示数据库的代谢通路解析能力。2026-2-11 测序技术
细胞内TDP-43淀粉样蛋白成核起源于被阻断的新生凝聚体bioRxiv创新性地揭示TDP-43淀粉样蛋白形成依赖于特定物理条件,发现CTD域形成的动态阻断簇是淀粉样成核的必要前提,且该过程受其他蛋白淀粉样模板调控,为神经退行性疾病治疗提供新靶点。2026-2-11 蛋白质组学
人类天冬氨酸蛋白酶肽LL-37与核酸复合物形成中的调控及结合模式研究及其对中性粒细胞胞外陷阱的影响bioRxiv创新性揭示LL-37与dsDNA的浓度依赖性结合机制,发现其通过α-螺旋结构而非静电作用实现核酸凝集,阐明LL-37对NETs的浓度依赖性调控作用,为SLE等疾病提供新的生物物理机制解释。2026-2-11 核酸蛋白工具酶
饮食诱导的巨噬细胞驱动的炎症促进胰腺可塑性和侵袭性bioRxiv发现高脂饮食通过巨噬细胞分泌CAMP激活P2RX7信号通路,诱导肿瘤细胞获得高可塑性和免疫逃逸表型,并揭示BMI与CAMP-P2RX7-CXCR4分子标志物的关联,阐明了肥胖相关胰腺癌的代谢-免疫调控机制。2026-2-11 基因编辑 蛋白质组学