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Ornithodoros phacochoerus蜱虫中的微生物群落：空间结构及非洲猪瘟病毒传染状态的影响

首次揭示了Ornithodoros phacochoerus蜱虫微生物群落的低多样性特征（仅含主要共生菌Francisella-like endosymbiont和次要共生菌Rickettsiella），发现其微生物群落存在显著的空间结构特征，且非洲猪瘟病毒传染状态与微生物群落组成无显著关联，这与硬蜱研究结果存在差异。

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空间组学

无动物源性胨不影响治疗用噬菌体的增殖

首次系统结合表型和基因组评估方法，证明无动物源性培养基可替代传统动物源性培养基用于治疗用噬菌体生产，且不影响噬菌体产量、杀菌活性和基因组特征。

测序技术

识别调控肺细胞增强子报告基因活性的严重COVID-19风险变异体

创新性地使用STAR-seq技术大规模筛选严重COVID-19相关变异体对肺上皮细胞调控活性的影响，发现29个等位基因特异性调控变异体，并通过深度学习模型解析其作用机制，为疾病修饰基因提供候选靶点。

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工业黑化在胡椒蛾中的平行进化：一个位点，多个等位基因

发现欧洲胡椒蛾黑化现象的遗传基础与英国存在差异，欧洲黑化由ivory位点多个结构变异等位基因（如805bp缺失sollichau）驱动，而非英国的carb-TE插入；不同结构变异通过调控ivory基因和mir-193微RNA表达实现相似表型，揭示同一适应性性状可由不同遗传机制平行进化。

测序技术

Macromiidae科（蜻蜓目：差翅亚目）的系统发育、多样化及生物地理学

创新性地使用锚定杂交富集技术对62个物种进行密集采样，构建最完整的系统发育框架；首次揭示雄性外生殖器特征的进化模式；通过化石校准确定科级分化时间（晚渐新世），并阐明不同属的生物地理演化历史。

测序技术

基于Peptidisc的DIA-MS揭示雌性APP小鼠毒蕈碱乙酰胆碱受体M1调节后的膜蛋白组重塑

1. 开发膜模拟数据非依赖采集（DIA）蛋白质组学方法，突破传统可溶性蛋白组分析的局限性；2. 发现APP小鼠模型中AD相关膜蛋白（RyR2/PLD3等）的基因型特异性重塑；3. 揭示M1受体激活对疾病相关膜网络（SORCS2/PLXND1等）的选择性调控；4. 建立Peptidisc膜蛋白组学技术平台，为AD生物标志物发现和药物靶点验证提供新方法。

蛋白质组学

测序技术

利用信息论方法量化核酸马达序列依赖响应及其在纳米孔DNA测序中的应用

创新性地采用互信息理论量化解旋酶动力学的序列依赖性，并证明该动力学特征可提升所有标准DNA碱基的测序准确性

测序技术

核酸蛋白工具酶

单细胞超高通量多重染色质可及性与基因表达测序（SUM-seq）

创新性地实现单细胞水平染色质可及性与基因表达的同时分析，通过样本特异性原位条形码技术和高通量液滴过载实现样本多重化处理，显著提升通量和通量效率。

单细胞测序

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BARTsc从单细胞组学数据中识别关键转录调控因子

创新点包括：1) 提出基于公共ChIP-seq数据的新框架，结合单细胞多组学数据（scRNA-seq/scATAC-seq/scMultiome）推断顺式调控图谱；2) 首次实现跨细胞簇的转录调控因子活性量化；3) 在多种生物系统（小鼠皮层、人PBMCs、PDAC）中验证方法普适性；4) 发现新型PDAC关键调控因子NEFLA并实验验证其功能。

单细胞测序

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