msmu：基于MuData的模块化和可追溯的液相色谱-质谱联用蛋白质组学数据分析的Python工具包bioRxiv创新性地整合MuData格式实现数据溯源与透明性，构建端到端的可重复分析流程，通过结构化数据格式提升蛋白质组学数据的互操作性与FAIR原则符合性。2026-1-8 蛋白质组学
靶向GL-Lect驱动的内吞作用以抑制乳腺癌细胞可塑性bioRxiv首次发现GL-Lect介导的E-cadherin内吞新机制，揭示其通过EPN3与Galectin-3/Eps15家族协同调控上皮-间质可塑性及乳腺癌转移的分子路径，并验证了该机制作为治疗靶点的可行性。2026-1-8 基因编辑 蛋白质组学
构建顺式调控以定量调节谷类作物基因表达bioRxiv开发了基于MPRA的高通量筛选技术，发现核心启动子区域的突变可精准调控基因表达；通过紧凑型删除和motif插入使蛋白产量提升30倍以上，超越转基因增强子效果；建立了作物非转基因精准编辑的顺式调控精细映射策略。2026-1-8 基因编辑 合成生物学 蛋白质组学
Komagataella phaffii中bHLH蛋白Rtg1和RtgX的双重转录及转录后调控NAR首次发现KpRtgX是KpRtg1的调控伴侣，揭示两者通过bHLH结构域相互作用并具有功能重叠；发现KpRtg1通过稳定KpRtgX蛋白调控代谢基因，且KpRtgX在细胞质中通过转录后机制调控GDH2和PEPCK；保守精氨酸残基对复合物形成至关重要。2026-1-8 蛋白质组学 基因编辑
受精触发哺乳动物胚胎早期蛋白质组对称性打破Cell首次通过单细胞蛋白质组学揭示哺乳动物胚胎在2细胞阶段出现姐妹卵裂球的alpha-beta不对称性，发现该不对称性由受精触发并贯穿胚胎发育早期，且与细胞发育潜能差异显著相关。2025-12-3 蛋白质组学 单细胞测序
利用先进DNA通用微阵列量化转录因子特异性：长且修饰结合位点NAR开发了两种增强平台Ex-uPBM和Mod-uPBM，分别通过扩展高阶de Bruijn序列和整合修饰碱基，实现了对长达10bp的DNA motif特异性分析，并首次系统量化了5mC修饰在全上下文中的能量效应。2025-12-29 蛋白质组学 测序技术
核FNBP4在肌动蛋白结合与Formin FMN1抑制中的双重调控作用bioRxiv首次发现FNBP4作为核内肌动蛋白结合蛋白，通过C端KRRK基序直接结合肌动蛋白，同时通过N端WW结构域抑制Formin FMN1的活性，且全长蛋白表现出协同抑制效应，揭示了核肌动蛋白组织的新调控机制。2026-1-5 蛋白质组学
沙门氏菌SPI2系统利用可检测的针状结构逃避NAIP/NLRC4检测bioRxiv发现SPI2系统通过SpvC蛋白抑制NLRC4激活，并通过精确调控SsaG表达量实现免疫逃逸，揭示了细菌利用可检测分子逃避免疫识别的新机制。2026-1-5 蛋白质组学
CARMIL膜结合结构域的生化功能bioRxiv发现CARMIL的MB结构域通过靶向膜结合位点调控CP活性，揭示其促进Arp2/3介导的肌动蛋白组装的双重机制：既可靶向膜结合区域，又能在脱离膜后增强CP激活能力，为膜相关肌动蛋白动态调控提供新视角。2026-1-5 蛋白质组学
NetMHCIIphosPan：一种用于预测磷酸化肽段通过HLA II类分子呈递的机器学习工具bioRxiv创新点包括：1) 开发基于质谱免疫肽组学数据的预测模型；2) 通过改进肽段鉴定流程提升预测性能；3) 首次发现HLA对磷酸配体的偏好与未修饰配体高度一致；4) 结合未修饰配体数据显著提升HLA-DP/DQ分子预测准确性；5) 在多个指标上优于现有工具NetMHCIIpan-4.3和MixMHC2pred-1.3。2026-1-5 蛋白质组学
